More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5726 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  100 
 
 
901 aa  1744    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  31.2 
 
 
431 aa  142  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  33.95 
 
 
963 aa  141  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  30.03 
 
 
475 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  32.32 
 
 
415 aa  138  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
687 aa  134  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 
795 aa  122  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  30.58 
 
 
463 aa  118  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  38.4 
 
 
1454 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 
774 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  26.17 
 
 
653 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  31.67 
 
 
352 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  24.49 
 
 
652 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  26.18 
 
 
432 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  33.21 
 
 
457 aa  110  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  29.83 
 
 
423 aa  108  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  26.67 
 
 
445 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  26.21 
 
 
514 aa  99.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  29.54 
 
 
371 aa  99.4  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  27.22 
 
 
371 aa  98.6  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  36.82 
 
 
422 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
322 aa  92.8  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  32.08 
 
 
450 aa  92.8  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  36.32 
 
 
422 aa  91.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  24.66 
 
 
322 aa  90.5  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  23.5 
 
 
1682 aa  89.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  35.08 
 
 
365 aa  89  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  25.2 
 
 
322 aa  89  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  28.84 
 
 
374 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  28.49 
 
 
484 aa  87.4  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  24.41 
 
 
396 aa  86.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  27.73 
 
 
371 aa  86.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  29.55 
 
 
382 aa  86.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  27.35 
 
 
616 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  28.69 
 
 
383 aa  84  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  29.65 
 
 
611 aa  83.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  33.01 
 
 
619 aa  83.2  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  25.14 
 
 
2122 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  35.56 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  27.73 
 
 
451 aa  80.9  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  26.71 
 
 
475 aa  80.9  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  31.17 
 
 
438 aa  80.5  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  34.35 
 
 
440 aa  79  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  22.96 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  22.69 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
861 aa  78.2  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  28.19 
 
 
448 aa  77.4  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  29.1 
 
 
1812 aa  77  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1290  Pyrrolo-quinoline quinone  26.09 
 
 
442 aa  77.4  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  27.87 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  23.7 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  27.14 
 
 
458 aa  75.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  26.71 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  27.82 
 
 
389 aa  74.3  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  24.47 
 
 
395 aa  73.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  24.47 
 
 
395 aa  73.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  28.06 
 
 
454 aa  72.4  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  27.08 
 
 
379 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  30.07 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  26.8 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.8 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  26.2 
 
 
1969 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  31.13 
 
 
349 aa  70.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  31.53 
 
 
397 aa  70.5  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  26.2 
 
 
2036 aa  70.1  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.41 
 
 
386 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  30.07 
 
 
454 aa  70.1  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  28.76 
 
 
705 aa  69.3  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  30.59 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  25.59 
 
 
383 aa  69.3  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.83 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  27.18 
 
 
384 aa  69.7  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  23.11 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  29.89 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  30.45 
 
 
611 aa  68.9  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  26.64 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  29.41 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  25.85 
 
 
444 aa  68.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  28.21 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  29.9 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  23.66 
 
 
499 aa  68.2  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  28.52 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  23.66 
 
 
499 aa  68.2  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  25.83 
 
 
469 aa  67.8  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0572  hypothetical protein  29.02 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.269185  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  26.74 
 
 
412 aa  67.4  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  25.75 
 
 
461 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  25.86 
 
 
455 aa  66.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0865  Pyrrolo-quinoline quinone  20.67 
 
 
611 aa  66.6  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3570  Pyrrolo-quinoline quinone  24.78 
 
 
451 aa  66.6  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3015  Pyrrolo-quinoline quinone  32.65 
 
 
416 aa  66.6  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  26.79 
 
 
402 aa  66.2  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  27.01 
 
 
439 aa  66.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4195  Pyrrolo-quinoline quinone  25.51 
 
 
404 aa  66.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.56 
 
 
414 aa  65.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  29.57 
 
 
546 aa  65.1  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3316  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  26.74 
 
 
545 aa  64.7  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  26.46 
 
 
1300 aa  64.7  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0160  Pyrrolo-quinoline quinone  27.45 
 
 
471 aa  63.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0726185  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.33 
 
 
380 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>