286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1550 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 809 aa  1656    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  43.07 
 
 		 797 aa  594  1e-168  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  55.32 
 
 		 2036 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  55.32 
 
 		 1969 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  55.64 
 
 		 2272 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  54.45 
 
 		 1067 aa  430  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  34.82 
 
 		 834 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  46.92 
 
 		 1311 aa  304  5.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  44.53 
 
 		 497 aa  293  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  41.67 
 
 		 1300 aa  264  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  29.49 
 
 		 1241 aa  263  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  41.34 
 
 		 556 aa  260  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  37.94 
 
 		 1328 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  34.34 
 
 		 656 aa  227  8e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  31.2 
 
 		 1009 aa  207  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  35.12 
 
 		 1842 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  32.66 
 
 		 612 aa  161  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  31.47 
 
 		 635 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  28.48 
 
 		 484 aa  137  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3735  cell surface protein  28.48 
 
 		 430 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1801  hypothetical protein  30.19 
 
 		 626 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  33.6 
 
 		 795 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  26.37 
 
 		 687 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  25.93 
 
 		 463 aa  97.8  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  27.21 
 
 		 450 aa  97.4  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  26.43 
 
 		 1812 aa  95.9  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  25.58 
 
 		 431 aa  92.4  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  27.14 
 
 		 432 aa  88.2  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  25.6 
 
 		 423 aa  86.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  31.88 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  26.04 
 
 		 652 aa  85.1  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  27.27 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  26.2 
 
 		 653 aa  81.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  24.04 
 
 		 774 aa  81.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  27.41 
 
 		 475 aa  77.4  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  25.19 
 
 		 415 aa  77  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  25.07 
 
 		 412 aa  76.6  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04620  FOG: WD40-like repeat protein  24.49 
 
 		 1533 aa  76.6  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  29.97 
 
 		 963 aa  75.5  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  24.18 
 
 		 1454 aa  74.7  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  25.27 
 
 		 484 aa  73.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  22.83 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  24.15 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  24.15 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  21.29 
 
 		 619 aa  69.3  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  25.13 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  24.15 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  23.75 
 
 		 407 aa  67  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  23.12 
 
 		 445 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0893  Pyrrolo-quinoline quinone  24.69 
 
 		 645 aa  67  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0865  Pyrrolo-quinoline quinone  25.7 
 
 		 611 aa  66.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  25.21 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  29.81 
 
 		 499 aa  65.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  29.81 
 
 		 499 aa  65.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  23.71 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  23.1 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0991  Pyrrolo-quinoline quinone  24.48 
 
 		 1261 aa  64.7  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.620303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  24.12 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0851  Pyrrolo-quinoline quinone  24.2 
 
 		 558 aa  64.3  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  22.78 
 
 		 371 aa  63.9  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  33.09 
 
 		 469 aa  63.9  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1682 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  23.66 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  23.64 
 
 		 611 aa  62.4  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  22.66 
 
 		 514 aa  62  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  28.07 
 
 		 616 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  23.48 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  23.99 
 
 		 901 aa  61.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.92 
 
 		 386 aa  60.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  35 
 
 		 399 aa  60.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  23.3 
 
 		 395 aa  60.1  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4033  Pyrrolo-quinoline quinone  30.77 
 
 		 431 aa  60.1  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  23.48 
 
 		 455 aa  60.1  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.88 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  25.09 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  23.19 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  24.34 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  25.38 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  23.76 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  23.76 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  26.94 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  25.98 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  25.96 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  22.66 
 
 		 457 aa  57.4  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3105  Pyrrolo-quinoline quinone  24.38 
 
 		 453 aa  57.4  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  27.06 
 
 		 587 aa  57.4  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1209  WD40-like protein repeat-like protein  27.78 
 
 		 446 aa  57  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.415141  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  22.38 
 
 		 434 aa  57.4  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.14 
 
 		 1383 aa  57.4  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.38 
 
 		 385 aa  57.4  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  24.22 
 
 		 420 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  25.28 
 
 		 383 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  22.81 
 
 		 363 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  24.73 
 
 		 402 aa  56.2  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  24.39 
 
 		 392 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  24.39 
 
 		 392 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.39 
 
 		 392 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24 
 
 		 392 aa  55.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.39 
 
 		 392 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.39 
 
 		 392 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>