152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0865 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0865  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
611 aa  1249    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1817  Pyrrolo-quinoline quinone  25.45 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.216395  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  22.18 
 
 
687 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  24.56 
 
 
774 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  25.7 
 
 
809 aa  66.2  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  30.6 
 
 
1300 aa  65.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  21.66 
 
 
901 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  24.92 
 
 
963 aa  65.1  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  19.08 
 
 
653 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  25.25 
 
 
450 aa  64.3  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  18.42 
 
 
652 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  29.35 
 
 
384 aa  60.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  25.17 
 
 
386 aa  60.8  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  29.35 
 
 
384 aa  60.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  20.62 
 
 
445 aa  60.8  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  26.24 
 
 
371 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  20.69 
 
 
705 aa  59.7  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  33.93 
 
 
497 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  26.67 
 
 
2272 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 
795 aa  60.1  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  30.52 
 
 
1311 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  23.32 
 
 
484 aa  58.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  31.07 
 
 
1067 aa  57.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  21.54 
 
 
431 aa  58.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  23.45 
 
 
387 aa  57.8  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  19.39 
 
 
1812 aa  56.2  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.22 
 
 
415 aa  56.2  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  27.54 
 
 
1969 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  21.85 
 
 
616 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  22.84 
 
 
422 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  28.47 
 
 
797 aa  55.1  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  25.53 
 
 
371 aa  55.1  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  22.47 
 
 
415 aa  54.7  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  30.63 
 
 
2036 aa  54.3  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.61 
 
 
396 aa  54.3  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  25.33 
 
 
1454 aa  53.9  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  24.34 
 
 
407 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  24.84 
 
 
381 aa  52.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.57 
 
 
395 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  28.57 
 
 
395 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  29.41 
 
 
352 aa  52.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2190  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.69 
 
 
380 aa  52  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  27.27 
 
 
382 aa  52  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  24.48 
 
 
399 aa  52  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  21.79 
 
 
463 aa  51.6  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  22.76 
 
 
412 aa  51.2  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  27.34 
 
 
439 aa  51.2  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  26.79 
 
 
451 aa  50.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0884  Pyrrolo-quinoline quinone  30.47 
 
 
342 aa  50.8  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0837922  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1093  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.48 
 
 
375 aa  50.4  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1173  Pyrrolo-quinoline quinone  26.28 
 
 
383 aa  50.4  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.579811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  24.21 
 
 
458 aa  50.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.64 
 
 
392 aa  50.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  23.47 
 
 
371 aa  50.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  27.01 
 
 
422 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  23.13 
 
 
820 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  23.83 
 
 
383 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  24.43 
 
 
861 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  21.88 
 
 
381 aa  49.7  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.1 
 
 
392 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  20.41 
 
 
396 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  24.43 
 
 
372 aa  48.9  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  31.18 
 
 
432 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  24.88 
 
 
383 aa  48.5  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  23.1 
 
 
475 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1993  hypothetical protein  31.25 
 
 
369 aa  48.5  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.041512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  25.75 
 
 
379 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  24.69 
 
 
392 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.21 
 
 
414 aa  48.5  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.33 
 
 
393 aa  48.5  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0522  quino protein  23.62 
 
 
387 aa  48.5  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
381 aa  48.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  24.69 
 
 
392 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  25.93 
 
 
606 aa  48.5  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.69 
 
 
392 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.69 
 
 
392 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.69 
 
 
392 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.16 
 
 
393 aa  48.5  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.44 
 
 
393 aa  47.8  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  23.53 
 
 
445 aa  48.1  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  22.08 
 
 
381 aa  47.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2304  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
379 aa  47.8  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.262022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.45 
 
 
393 aa  47.8  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.87 
 
 
392 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.87 
 
 
392 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.87 
 
 
392 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.87 
 
 
392 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  20.38 
 
 
397 aa  47.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05030  predicted phosphohydrolase  23.27 
 
 
726 aa  47.4  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.95 
 
 
392 aa  47.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  24.06 
 
 
381 aa  47.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  22.08 
 
 
381 aa  47.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  22.14 
 
 
603 aa  47.4  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0597  pyrrolo-quinoline quinone  22.27 
 
 
380 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.601567 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  23.61 
 
 
454 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  21.6 
 
 
556 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  21.74 
 
 
350 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  22 
 
 
423 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.97 
 
 
392 aa  46.6  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.27 
 
 
392 aa  46.6  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>