141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0884 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0884  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
342 aa  671    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0837922  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  31.34 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 
795 aa  72.4  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  27.73 
 
 
475 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  35.65 
 
 
687 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  29.3 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  26.58 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  26.09 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  27.52 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  26.92 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  27.96 
 
 
438 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  27.81 
 
 
774 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  27.15 
 
 
352 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  28.97 
 
 
463 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  25.61 
 
 
1812 aa  60.8  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  28 
 
 
371 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2190  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  37.3 
 
 
380 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2304  Pyrrolo-quinoline quinone  41.67 
 
 
379 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.262022  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  32.77 
 
 
861 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  25.56 
 
 
963 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  29.13 
 
 
397 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  27.27 
 
 
705 aa  57.4  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  29.43 
 
 
1454 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1993  hypothetical protein  39.05 
 
 
369 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.041512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  30.28 
 
 
432 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  28.89 
 
 
616 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  22.11 
 
 
514 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.8 
 
 
380 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  27.24 
 
 
402 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  24.68 
 
 
382 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  25.71 
 
 
384 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1427  Pyrrolo-quinoline quinone  36.73 
 
 
385 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390879  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  20.96 
 
 
445 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  26.87 
 
 
611 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0077  Pyrrolo-quinoline quinone  36.79 
 
 
397 aa  53.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.825382  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  28 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  27.56 
 
 
415 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  35.81 
 
 
484 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  37.5 
 
 
363 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  29.63 
 
 
653 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  26.58 
 
 
534 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  36.44 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 
652 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  29.91 
 
 
439 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  26.32 
 
 
423 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  33.03 
 
 
381 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  25.1 
 
 
448 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0865  Pyrrolo-quinoline quinone  30.47 
 
 
611 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28 
 
 
389 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  36.46 
 
 
363 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  35.71 
 
 
678 aa  50.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  31.62 
 
 
455 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  33.03 
 
 
384 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27 
 
 
386 aa  49.7  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  23.66 
 
 
461 aa  49.7  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  24.26 
 
 
387 aa  49.7  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  27.6 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  21.23 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.7 
 
 
579 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  23.97 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.91 
 
 
380 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  23.97 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3154  hypothetical protein  22.1 
 
 
631 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.164464  hitchhiker  0.00920589 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  32.76 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  36.36 
 
 
389 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0804  Pyrrolo-quinoline quinone  23.85 
 
 
536 aa  48.5  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  27.6 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4237  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 
588 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000286239  hitchhiker  0.000138853 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  29.67 
 
 
372 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  26.63 
 
 
611 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  20.34 
 
 
797 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  27.09 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  23.99 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4195  Pyrrolo-quinoline quinone  28.48 
 
 
404 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  30.83 
 
 
458 aa  47  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31 
 
 
386 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  24.19 
 
 
589 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  25.88 
 
 
450 aa  47  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  22.99 
 
 
448 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  33.75 
 
 
411 aa  46.6  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.49 
 
 
392 aa  46.6  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  36.75 
 
 
454 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  28.77 
 
 
901 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.68 
 
 
395 aa  46.2  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  24.35 
 
 
380 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  24.42 
 
 
402 aa  46.2  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  22.99 
 
 
454 aa  46.2  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  20.9 
 
 
384 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  20.9 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  26.61 
 
 
381 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  23.15 
 
 
407 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  24.21 
 
 
381 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1173  Pyrrolo-quinoline quinone  32.08 
 
 
383 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.579811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  27.04 
 
 
572 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  42.86 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  22.75 
 
 
398 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000513554  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.21 
 
 
350 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1384  Pyrrolo-quinoline quinone  32.97 
 
 
612 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.868816  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1093  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.08 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>