167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3214 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
349 aa  682    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  29.23 
 
 
431 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  29.41 
 
 
484 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  30.73 
 
 
463 aa  87  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 
795 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 
963 aa  84  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  30.03 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  25.39 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  37.5 
 
 
1454 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  27.84 
 
 
432 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  31.13 
 
 
901 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  27.18 
 
 
687 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  26.76 
 
 
475 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  31.45 
 
 
611 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  27.15 
 
 
774 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  35.62 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  29.01 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  27.16 
 
 
423 aa  66.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 
475 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  25.35 
 
 
653 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
652 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  27.78 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 
457 aa  60.5  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  24.26 
 
 
387 aa  60.1  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  29.67 
 
 
415 aa  60.1  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
861 aa  59.7  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.3 
 
 
386 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  34.39 
 
 
372 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  30.19 
 
 
445 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  27.69 
 
 
514 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  30.67 
 
 
705 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3315  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  31.61 
 
 
557 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  24.72 
 
 
1328 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  25.63 
 
 
386 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  31.43 
 
 
422 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.6 
 
 
385 aa  57.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.11 
 
 
380 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  24.72 
 
 
1241 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  30.2 
 
 
448 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.63 
 
 
381 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  28.63 
 
 
374 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  28.4 
 
 
371 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.92 
 
 
381 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  24.92 
 
 
381 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  29.65 
 
 
458 aa  56.2  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  24.92 
 
 
381 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  26.17 
 
 
407 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  32.53 
 
 
365 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  29.11 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  32.57 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  28.4 
 
 
797 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  29.11 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.37 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  25.4 
 
 
417 aa  54.3  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  32.95 
 
 
363 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  30.5 
 
 
422 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.12 
 
 
381 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1817  Pyrrolo-quinoline quinone  21.78 
 
 
400 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.216395  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  27.4 
 
 
402 aa  53.9  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  24.39 
 
 
384 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  24.04 
 
 
384 aa  53.1  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  29.38 
 
 
455 aa  53.1  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  29.52 
 
 
438 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  25.16 
 
 
381 aa  52.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  24.38 
 
 
381 aa  52.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  32.39 
 
 
363 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  28.57 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  25.85 
 
 
616 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  23.75 
 
 
381 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.75 
 
 
350 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0685  hypothetical protein  24.35 
 
 
387 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000893693  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  24.71 
 
 
396 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.44 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.42 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.68 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  24.53 
 
 
381 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  29.61 
 
 
1812 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  24.53 
 
 
381 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  24.53 
 
 
381 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  24.53 
 
 
381 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  24.53 
 
 
381 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  23.99 
 
 
381 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3316  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  29.9 
 
 
545 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  25.59 
 
 
1969 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  28.8 
 
 
444 aa  50.8  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  26.34 
 
 
402 aa  50.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  24.53 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  25.76 
 
 
322 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.04 
 
 
393 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  31.28 
 
 
381 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  25.59 
 
 
2036 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  30.4 
 
 
372 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  27.23 
 
 
379 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0077  Pyrrolo-quinoline quinone  28.87 
 
 
397 aa  49.7  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.825382  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  30.56 
 
 
383 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.27 
 
 
392 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1290  Pyrrolo-quinoline quinone  25.86 
 
 
442 aa  49.3  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  28.02 
 
 
1300 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.65 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30 
 
 
402 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>