204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1384 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1384  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
612 aa  1199    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.868816  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02746  polyvinylalcohol dehydrogenase  35.73 
 
 
561 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  21.95 
 
 
705 aa  87.4  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1323  Pyrrolo-quinoline quinone  22.66 
 
 
639 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0969  Pyrrolo-quinoline quinone  22.3 
 
 
541 aa  82  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  24.41 
 
 
575 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2797  Pyrrolo-quinoline quinone  21.94 
 
 
557 aa  71.6  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  24.41 
 
 
575 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  23.76 
 
 
575 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  23.76 
 
 
575 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  22.82 
 
 
573 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  22.59 
 
 
573 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  22.82 
 
 
573 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  25.5 
 
 
573 aa  69.3  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  22.63 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2985  PQQ-dependent enzyme-like protein  23.49 
 
 
618 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.926915  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  22.38 
 
 
576 aa  68.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  23.1 
 
 
709 aa  67  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  24.41 
 
 
575 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  22.68 
 
 
738 aa  64.7  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  21.65 
 
 
718 aa  64.3  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  22.15 
 
 
568 aa  64.3  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  24.4 
 
 
588 aa  63.9  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  22.83 
 
 
730 aa  63.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  24.62 
 
 
423 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  22.7 
 
 
431 aa  62.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.82 
 
 
386 aa  62  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  22.08 
 
 
724 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  22.08 
 
 
562 aa  61.6  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  20.25 
 
 
570 aa  61.6  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  22.32 
 
 
727 aa  61.2  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  24.32 
 
 
387 aa  60.8  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  23.5 
 
 
577 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  22.01 
 
 
576 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.01 
 
 
584 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.01 
 
 
584 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  25.4 
 
 
407 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  23.53 
 
 
592 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  22.34 
 
 
365 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  22.55 
 
 
706 aa  58.9  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  28.48 
 
 
445 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  21.77 
 
 
589 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  24.77 
 
 
591 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  24.36 
 
 
386 aa  58.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  20 
 
 
718 aa  57.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  19.83 
 
 
712 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  27.27 
 
 
475 aa  57.4  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  22.83 
 
 
726 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  22.86 
 
 
774 aa  57.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0849  Pyrrolo-quinoline quinone  22.74 
 
 
528 aa  57.4  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3393  putative methanol dehydrogenase protein, large subunit  25.35 
 
 
606 aa  57.4  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.078697  normal  0.0119159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2867  Pyrrolo-quinoline quinone  21.15 
 
 
614 aa  56.6  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0638606 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0379  Pyrrolo-quinoline quinone  26.98 
 
 
727 aa  57  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.4 
 
 
393 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.81 
 
 
385 aa  55.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  23.87 
 
 
580 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  24.7 
 
 
484 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.4 
 
 
393 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  23.67 
 
 
587 aa  56.2  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  20.68 
 
 
616 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  24.12 
 
 
412 aa  56.2  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  21.5 
 
 
687 aa  56.2  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.4 
 
 
393 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  22.4 
 
 
697 aa  55.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  27.31 
 
 
583 aa  55.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  20.7 
 
 
587 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  20.28 
 
 
707 aa  55.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  20.7 
 
 
587 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  23.12 
 
 
579 aa  55.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  20.5 
 
 
721 aa  54.7  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  22.17 
 
 
797 aa  54.3  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  18.77 
 
 
652 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3106  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  23.94 
 
 
606 aa  53.9  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
619 aa  53.9  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  26.24 
 
 
582 aa  53.5  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.53 
 
 
393 aa  53.5  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  22.4 
 
 
678 aa  53.5  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  19.27 
 
 
653 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  22.57 
 
 
587 aa  52.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0680  penicillin-binding protein  33.75 
 
 
942 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0673  PQQ-dependent enzyme-like protein  19.45 
 
 
569 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  19.79 
 
 
587 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  21.01 
 
 
698 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1717  Pyrrolo-quinoline quinone  25.84 
 
 
620 aa  52  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000584084  unclonable  0.000000429175 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1286  cytochrome c class I  25.29 
 
 
701 aa  52  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  23.23 
 
 
561 aa  51.6  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  27.17 
 
 
400 aa  51.6  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.62 
 
 
392 aa  51.6  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  27.61 
 
 
708 aa  51.2  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4160  Pyrrolo-quinoline quinone  20.59 
 
 
690 aa  51.6  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0349949 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  29.91 
 
 
395 aa  50.8  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  23.91 
 
 
384 aa  50.4  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  26.18 
 
 
593 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.87 
 
 
392 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  23.34 
 
 
363 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.87 
 
 
392 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  22.22 
 
 
602 aa  50.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.87 
 
 
392 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.87 
 
 
392 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  31.76 
 
 
1060 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>