91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0804 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0804  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 536 aa  1073    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  36.8 
 
 		 499 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  36.8 
 
 		 499 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0137  Pyrrolo-quinoline quinone  29.54 
 
 		 481 aa  113  7.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  25.97 
 
 		 475 aa  93.2  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.59 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  23.35 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  23.35 
 
 		 384 aa  60.1  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  28.44 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  25.16 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  24.41 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  23.68 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  25.35 
 
 		 705 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.75 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  22.95 
 
 		 797 aa  55.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  22.48 
 
 		 387 aa  53.9  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  25.85 
 
 		 399 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  29.67 
 
 		 570 aa  52.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  22.68 
 
 		 445 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1981  PQQ enzyme repeat protein  29.85 
 
 		 509 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1649  Pyrrolo-quinoline quinone  29.85 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000205987  normal  0.0168641 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  24.28 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  25.52 
 
 		 963 aa  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  22.91 
 
 		 382 aa  52  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.21 
 
 		 393 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  25.63 
 
 		 795 aa  50.4  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  24.23 
 
 		 455 aa  50.4  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1067 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  23.69 
 
 		 431 aa  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  24.22 
 
 		 389 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  26.81 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  23.32 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  30.82 
 
 		 595 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.81 
 
 		 392 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  23.32 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.81 
 
 		 392 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  26.81 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.81 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.81 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.81 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  30.82 
 
 		 595 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.81 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  19.6 
 
 		 687 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  23.79 
 
 		 381 aa  48.5  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  23.55 
 
 		 432 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.38 
 
 		 386 aa  48.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.14 
 
 		 391 aa  48.1  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  22.3 
 
 		 652 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.38 
 
 		 393 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  23.32 
 
 		 611 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  21.93 
 
 		 461 aa  47.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.14 
 
 		 595 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.72 
 
 		 402 aa  47.4  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.81 
 
 		 392 aa  47.4  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  22.59 
 
 		 400 aa  47.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  20.81 
 
 		 457 aa  47  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  23.28 
 
 		 372 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  22.37 
 
 		 379 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.06 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  22.9 
 
 		 383 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  23.35 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  23.86 
 
 		 381 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  24.87 
 
 		 384 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  28.49 
 
 		 1328 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  23.71 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  23.71 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  24.48 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.83 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.32 
 
 		 380 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  21.59 
 
 		 458 aa  45.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  29.09 
 
 		 1300 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  25.76 
 
 		 514 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.2 
 
 		 575 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  23.85 
 
 		 1241 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.69 
 
 		 393 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  22.07 
 
 		 374 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.69 
 
 		 393 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  25.2 
 
 		 575 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  27.04 
 
 		 448 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  24.76 
 
 		 423 aa  44.3  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  22.45 
 
 		 380 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  27.04 
 
 		 454 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  23.13 
 
 		 380 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.27 
 
 		 395 aa  43.9  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  22.32 
 
 		 2036 aa  43.9  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  24.84 
 
 		 420 aa  43.5  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.16 
 
 		 350 aa  43.5  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.69 
 
 		 393 aa  43.5  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  23.16 
 
 		 381 aa  43.5  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  22.68 
 
 		 448 aa  43.5  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  23.44 
 
 		 1311 aa  43.5  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>