119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0258 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 420 aa  847    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  30.84 
 
 		 434 aa  186  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1863  Pyrrolo-quinoline quinone  30.32 
 
 		 462 aa  172  7.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  29.8 
 
 		 437 aa  167  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  27.19 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2376  Pyrrolo-quinoline quinone  28.61 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4240  Pyrrolo-quinoline quinone  32.79 
 
 		 490 aa  137  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00516774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1848  Pyrrolo-quinoline quinone  27.1 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  26.1 
 
 		 466 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  24.7 
 
 		 934 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4033  Pyrrolo-quinoline quinone  27.01 
 
 		 431 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0221  Pyrrolo-quinoline quinone  23.32 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  25.5 
 
 		 1812 aa  96.7  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1978  hypothetical protein  26.3 
 
 		 489 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  31.19 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  23.81 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  24.75 
 
 		 556 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2733  hypothetical protein  21.73 
 
 		 530 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.735957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  22.82 
 
 		 1311 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0598  Pyrrolo-quinoline quinone  25.35 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  29.51 
 
 		 2272 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  26.6 
 
 		 834 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  28.69 
 
 		 1300 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  26.86 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  23.24 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 		 963 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  29.59 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  23.99 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2943  Pyrrolo-quinoline quinone  23.37 
 
 		 593 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  24.22 
 
 		 809 aa  57  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  24.22 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4007  hypothetical protein  20.1 
 
 		 608 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  23.68 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  24.68 
 
 		 583 aa  54.3  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3105  Pyrrolo-quinoline quinone  27.85 
 
 		 453 aa  54.3  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  23.4 
 
 		 1241 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  25.34 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.65 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  21.38 
 
 		 652 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0137  Pyrrolo-quinoline quinone  25.5 
 
 		 481 aa  53.5  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  23.56 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  22.8 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  24.86 
 
 		 1454 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  22.61 
 
 		 458 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  23.03 
 
 		 687 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  24.14 
 
 		 407 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  23.72 
 
 		 1328 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  24.68 
 
 		 570 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  23.05 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  21.38 
 
 		 653 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  23.86 
 
 		 461 aa  51.2  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  24.43 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1375  MoxR-like ATPases-like  23.8 
 
 		 1238 aa  50.4  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00027114  hitchhiker  0.0024969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  25.8 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 		 795 aa  50.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  23.68 
 
 		 475 aa  49.7  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.23 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  24.26 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.71 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.58 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0582  Pyrrolo-quinoline quinone  27.6 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.812129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.57 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1067 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  27.35 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  23.13 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.05 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.05 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.05 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.05 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  24.84 
 
 		 901 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.26 
 
 		 392 aa  46.6  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  26.55 
 
 		 497 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  23.05 
 
 		 797 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  24.1 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.75 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.75 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.75 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  20.86 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  26.56 
 
 		 861 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  24.29 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.49 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  27.66 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  24.08 
 
 		 708 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  22.29 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.52 
 
 		 392 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  27.16 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.95 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  28.24 
 
 		 611 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  22.34 
 
 		 475 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0865  Pyrrolo-quinoline quinone  27.27 
 
 		 611 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  22.79 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.79 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  27.47 
 
 		 455 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.79 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.79 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.79 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.79 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  22.33 
 
 		 374 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  22.79 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>