144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2944 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 934 aa  1930    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  29.41 
 
 		 434 aa  124  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  25.53 
 
 		 434 aa  118  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  24.7 
 
 		 420 aa  115  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2733  hypothetical protein  23.42 
 
 		 530 aa  106  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.735957  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2376  Pyrrolo-quinoline quinone  25.17 
 
 		 436 aa  104  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  26.17 
 
 		 437 aa  102  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  25.7 
 
 		 466 aa  94.4  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  25.56 
 
 		 442 aa  94  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4007  hypothetical protein  23.99 
 
 		 608 aa  89  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2943  Pyrrolo-quinoline quinone  22.47 
 
 		 593 aa  88.6  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1848  Pyrrolo-quinoline quinone  22.6 
 
 		 419 aa  84  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4033  Pyrrolo-quinoline quinone  24.05 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0221  Pyrrolo-quinoline quinone  22.02 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  23.08 
 
 		 556 aa  78.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0598  Pyrrolo-quinoline quinone  24.54 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1978  hypothetical protein  22.63 
 
 		 489 aa  73.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  23.44 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.05 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4240  Pyrrolo-quinoline quinone  26.81 
 
 		 490 aa  67.8  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00516774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  22.39 
 
 		 774 aa  67.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  25.16 
 
 		 687 aa  65.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  26.58 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  23.4 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.77 
 
 		 395 aa  60.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.39 
 
 		 393 aa  60.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  24.83 
 
 		 963 aa  59.3  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  24.08 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.55 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.18 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.39 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.39 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3953  Quinoprotein glucose dehydrogenase  29 
 
 		 747 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  24.69 
 
 		 431 aa  57  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  26.18 
 
 		 795 aa  57  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  24.66 
 
 		 374 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  26.93 
 
 		 432 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.63 
 
 		 395 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1863  Pyrrolo-quinoline quinone  20.47 
 
 		 462 aa  57  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  21.38 
 
 		 652 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  24.67 
 
 		 426 aa  56.6  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  27.8 
 
 		 463 aa  57  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.63 
 
 		 395 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  27.46 
 
 		 458 aa  55.5  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  22.99 
 
 		 653 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  27.14 
 
 		 445 aa  55.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.1 
 
 		 395 aa  54.7  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.69 
 
 		 415 aa  54.3  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.63 
 
 		 395 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  23.59 
 
 		 450 aa  53.9  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  28.46 
 
 		 475 aa  54.3  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.72 
 
 		 411 aa  53.5  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24 
 
 		 395 aa  53.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  25.42 
 
 		 820 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0969  Pyrrolo-quinoline quinone  27.38 
 
 		 541 aa  52.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.52 
 
 		 393 aa  53.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2450  PQQ-dependent enzyme-like protein  29.44 
 
 		 718 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  23.51 
 
 		 475 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  21.67 
 
 		 381 aa  51.6  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.35 
 
 		 395 aa  51.6  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  24.2 
 
 		 2036 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  24.78 
 
 		 1241 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  23.6 
 
 		 809 aa  50.4  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1165  pyrrolo-quinoline quinone  21.84 
 
 		 450 aa  50.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0116757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.84 
 
 		 393 aa  50.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  24.2 
 
 		 1969 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  24.32 
 
 		 402 aa  50.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  30.09 
 
 		 514 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  25.13 
 
 		 1454 aa  50.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  23.21 
 
 		 407 aa  50.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1014  Quinoprotein glucose dehydrogenase  25.88 
 
 		 732 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101534  normal  0.630139 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  24.35 
 
 		 1328 aa  49.7  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  22.84 
 
 		 448 aa  49.7  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  21.81 
 
 		 1812 aa  49.7  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  25.39 
 
 		 720 aa  49.7  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  21.3 
 
 		 461 aa  49.7  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  29.95 
 
 		 352 aa  48.9  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  25.08 
 
 		 718 aa  48.5  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  35.58 
 
 		 1015 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.6 
 
 		 392 aa  48.5  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  21.73 
 
 		 445 aa  48.9  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  22.84 
 
 		 454 aa  48.5  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1375  MoxR-like ATPases-like  28 
 
 		 1238 aa  48.1  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00027114  hitchhiker  0.0024969 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.49 
 
 		 395 aa  48.5  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  34.09 
 
 		 611 aa  47.8  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  22.55 
 
 		 392 aa  47.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.55 
 
 		 392 aa  47.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  26.55 
 
 		 372 aa  47.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.63 
 
 		 395 aa  47.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1359  Pyrrolo-quinoline quinone  23.72 
 
 		 377 aa  47.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000339921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.49 
 
 		 395 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.55 
 
 		 392 aa  47.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.55 
 
 		 392 aa  47.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.49 
 
 		 395 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.55 
 
 		 392 aa  47.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  25.56 
 
 		 484 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02746  polyvinylalcohol dehydrogenase  24.48 
 
 		 561 aa  47.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.49 
 
 		 395 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  22.55 
 
 		 392 aa  47.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  25.87 
 
 		 380 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>