96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0250 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 434 aa  894    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  40.96 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  30.84 
 
 		 420 aa  186  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  30.33 
 
 		 437 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2376  Pyrrolo-quinoline quinone  29.79 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  29.11 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1848  Pyrrolo-quinoline quinone  28.3 
 
 		 419 aa  163  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1863  Pyrrolo-quinoline quinone  24.94 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  29.41 
 
 		 934 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4033  Pyrrolo-quinoline quinone  26.39 
 
 		 431 aa  103  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  25.71 
 
 		 442 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2733  hypothetical protein  27.4 
 
 		 530 aa  87.4  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.735957  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4240  Pyrrolo-quinoline quinone  24.9 
 
 		 490 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00516774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4007  hypothetical protein  25.81 
 
 		 608 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0598  Pyrrolo-quinoline quinone  25.77 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0221  Pyrrolo-quinoline quinone  26.93 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1978  hypothetical protein  24.55 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2943  Pyrrolo-quinoline quinone  20.92 
 
 		 593 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  23.35 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.45 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  23.84 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  24.18 
 
 		 687 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  24.87 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  29.74 
 
 		 963 aa  57.4  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.75 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  25.38 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  23.11 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  21.93 
 
 		 556 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  24.27 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.07 
 
 		 402 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  22.82 
 
 		 834 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  21.21 
 
 		 705 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  22.95 
 
 		 774 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  23.01 
 
 		 463 aa  51.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  20.2 
 
 		 1812 aa  51.6  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  27.5 
 
 		 554 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.84 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  24.65 
 
 		 901 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.27 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  25.56 
 
 		 484 aa  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  25.29 
 
 		 455 aa  50.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  23.73 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  24.51 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  23.49 
 
 		 653 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  21.73 
 
 		 652 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  21.79 
 
 		 1311 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  22.26 
 
 		 809 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  23.59 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  22.48 
 
 		 1328 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1067 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  24.92 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  21.69 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  27.05 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.05 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  19.85 
 
 		 603 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  30.12 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  24.52 
 
 		 611 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.18 
 
 		 386 aa  47  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  24.44 
 
 		 1241 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  23.92 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  23.02 
 
 		 1454 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  24.46 
 
 		 619 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.75 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  28.81 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.78 
 
 		 350 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  23.85 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  25.95 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  19.48 
 
 		 603 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  31.25 
 
 		 381 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  28.81 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  24.14 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  23.34 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  28.77 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  28.77 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  28.15 
 
 		 534 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.61 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  20.64 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.17 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.13 
 
 		 393 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  28.44 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  28.44 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  28.44 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  28.44 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  28.44 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1444  glucose dehydrogenase (pyrroloquinoline-quinone)  29.47 
 
 		 803 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  25.47 
 
 		 2272 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.25 
 
 		 381 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  21.26 
 
 		 372 aa  43.5  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.9 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  23.45 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.9 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.25 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  31.01 
 
 		 381 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  31.01 
 
 		 381 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1081  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  28.42 
 
 		 803 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  24.31 
 
 		 384 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>