121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0982 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 437 aa  909    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  30.33 
 
 		 434 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  29.8 
 
 		 420 aa  167  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  27.84 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2376  Pyrrolo-quinoline quinone  30.17 
 
 		 436 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1848  Pyrrolo-quinoline quinone  25.58 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  27.11 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  27.54 
 
 		 466 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4033  Pyrrolo-quinoline quinone  28.85 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  26.17 
 
 		 934 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0221  Pyrrolo-quinoline quinone  26.72 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1863  Pyrrolo-quinoline quinone  23.94 
 
 		 462 aa  99  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2733  hypothetical protein  25.06 
 
 		 530 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.735957  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0598  Pyrrolo-quinoline quinone  27.61 
 
 		 441 aa  94  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1978  hypothetical protein  23.46 
 
 		 489 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4240  Pyrrolo-quinoline quinone  28.33 
 
 		 490 aa  87.4  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00516774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4007  hypothetical protein  25.19 
 
 		 608 aa  81.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  24.1 
 
 		 1812 aa  74.3  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  23.63 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.34 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  23.63 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  23.63 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  23.63 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  23.63 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  23.63 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  23.63 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  23.35 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  28.12 
 
 		 570 aa  62.4  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.45 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.63 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  23.35 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  23.35 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  24.35 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.9 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  23.9 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  24.15 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  22.07 
 
 		 556 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  22.09 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  22.38 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  23.08 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  23.63 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.25 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  23.67 
 
 		 431 aa  57  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  31.06 
 
 		 575 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  26.82 
 
 		 568 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  23.73 
 
 		 384 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  23.99 
 
 		 407 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  23.57 
 
 		 454 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  27.47 
 
 		 820 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  26.02 
 
 		 475 aa  53.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  21.45 
 
 		 1311 aa  53.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  23.33 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  24.01 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  24.01 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  23.5 
 
 		 1454 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  22.71 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  26.53 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  23.46 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.51 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  28.47 
 
 		 575 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  25.86 
 
 		 687 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  25.68 
 
 		 611 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.65 
 
 		 575 aa  50.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  26.18 
 
 		 575 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.6 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.6 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.6 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  20.95 
 
 		 901 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3700  Pyrrolo-quinoline quinone  30.3 
 
 		 154 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.65 
 
 		 575 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  23.79 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  21.92 
 
 		 861 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3153  hypothetical protein  22.05 
 
 		 637 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0308733  normal  0.0661061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  28.29 
 
 		 573 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.51 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  28.29 
 
 		 573 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  28.29 
 
 		 573 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 		 611 aa  47.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  23.32 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  20.36 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3393  putative methanol dehydrogenase protein, large subunit  28.73 
 
 		 606 aa  47.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.078697  normal  0.0119159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  26.19 
 
 		 383 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  23.11 
 
 		 458 aa  47  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  23.23 
 
 		 463 aa  46.6  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  21.33 
 
 		 381 aa  46.6  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  24.3 
 
 		 389 aa  46.6  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  20.5 
 
 		 1241 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2304  Pyrrolo-quinoline quinone  23.25 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.262022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  23.37 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  24.57 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  24.38 
 
 		 484 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  22.43 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  25.89 
 
 		 698 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.16 
 
 		 385 aa  45.8  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3105  Pyrrolo-quinoline quinone  23.62 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  24.04 
 
 		 963 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0619  Pyrrolo-quinoline quinone  23.79 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.051105  hitchhiker  0.000000261187 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  25 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  22.99 
 
 		 1328 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>