57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1978 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1978  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  994    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0221  Pyrrolo-quinoline quinone  27.86 
 
 		 447 aa  174  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2733  hypothetical protein  26.5 
 
 		 530 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.735957  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4007  hypothetical protein  26.28 
 
 		 608 aa  115  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  24.26 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4033  Pyrrolo-quinoline quinone  25.21 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0598  Pyrrolo-quinoline quinone  23.68 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  26.3 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  23.46 
 
 		 437 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  24.55 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  22.63 
 
 		 934 aa  73.6  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  25.47 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1848  Pyrrolo-quinoline quinone  26.97 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2376  Pyrrolo-quinoline quinone  21.95 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  21.77 
 
 		 562 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  27.2 
 
 		 466 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  26.56 
 
 		 383 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  24.47 
 
 		 556 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4240  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00516774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  24.89 
 
 		 1311 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  22.74 
 
 		 475 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  30.34 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  24.28 
 
 		 861 aa  50.1  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 963 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.37 
 
 		 385 aa  47.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  29.49 
 
 		 1454 aa  47.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  28.4 
 
 		 372 aa  47  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  23.15 
 
 		 426 aa  47.4  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1384  Pyrrolo-quinoline quinone  23.23 
 
 		 612 aa  47  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.868816  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  27.81 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  25.58 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  33.03 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  23.53 
 
 		 575 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  28.89 
 
 		 352 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  24.34 
 
 		 820 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  23.98 
 
 		 561 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2943  Pyrrolo-quinoline quinone  21.51 
 
 		 593 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  26.61 
 
 		 678 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.53 
 
 		 393 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  26.11 
 
 		 381 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.53 
 
 		 393 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  21.72 
 
 		 616 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.53 
 
 		 393 aa  44.3  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25 
 
 		 381 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  26.14 
 
 		 573 aa  44.3  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  26.35 
 
 		 399 aa  44.3  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  25.18 
 
 		 484 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  24.17 
 
 		 386 aa  43.9  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 381 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  24.44 
 
 		 381 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  24.44 
 
 		 381 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25 
 
 		 350 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3660  putative alcohol dehydrogenase  23.53 
 
 		 555 aa  43.5  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  25.29 
 
 		 475 aa  43.5  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  24.44 
 
 		 381 aa  43.5  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  28.8 
 
 		 398 aa  43.5  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000513554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.17 
 
 		 414 aa  43.5  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>