84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0598 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0598  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 441 aa  904    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4033  Pyrrolo-quinoline quinone  40.24 
 
 		 431 aa  293  6e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2733  hypothetical protein  28.15 
 
 		 530 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.735957  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4007  hypothetical protein  27.52 
 
 		 608 aa  136  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0221  Pyrrolo-quinoline quinone  26.96 
 
 		 447 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1978  hypothetical protein  23.68 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  26.57 
 
 		 466 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  28.11 
 
 		 437 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  25.77 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  24.77 
 
 		 934 aa  81.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  23.27 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2376  Pyrrolo-quinoline quinone  22.12 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  25.82 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1848  Pyrrolo-quinoline quinone  24.23 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4240  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00516774  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.04 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  29.21 
 
 		 572 aa  53.9  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.55 
 
 		 395 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.97 
 
 		 395 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1863  Pyrrolo-quinoline quinone  25.74 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.38 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.62 
 
 		 414 aa  50.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  24.28 
 
 		 458 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.57 
 
 		 395 aa  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 		 687 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.55 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  25.62 
 
 		 399 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3015  Pyrrolo-quinoline quinone  27.4 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0808  Pyrrolo-quinoline quinone  26.05 
 
 		 585 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.260733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1286  cytochrome c class I  30.13 
 
 		 701 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0969  Pyrrolo-quinoline quinone  28.19 
 
 		 541 aa  47.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.27 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  27.33 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_002978  WD0750  PQQ repeat-containing protein  22.84 
 
 		 353 aa  46.6  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.137969  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.31 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  32.26 
 
 		 834 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  24.61 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.53 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  25.69 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  26.2 
 
 		 587 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  22.74 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3619  Pyrrolo-quinoline quinone  26.43 
 
 		 581 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  30.51 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  25.91 
 
 		 697 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0851  Pyrrolo-quinoline quinone  31 
 
 		 558 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  21.7 
 
 		 455 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.66 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  27.1 
 
 		 721 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  29.68 
 
 		 727 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  26.77 
 
 		 706 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  25.87 
 
 		 1812 aa  44.3  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.65 
 
 		 395 aa  44.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  25.15 
 
 		 475 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  25.83 
 
 		 1328 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  26.45 
 
 		 562 aa  43.9  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  23.57 
 
 		 382 aa  44.3  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.23 
 
 		 395 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.23 
 
 		 395 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.23 
 
 		 395 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.23 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  25.83 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  25.83 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  25.75 
 
 		 384 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  27.27 
 
 		 718 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  25.83 
 
 		 1241 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  25.83 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  25.83 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  27.32 
 
 		 730 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  21.62 
 
 		 383 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  25.83 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  25.83 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  25.83 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.52 
 
 		 411 aa  43.5  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  25.59 
 
 		 365 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  27.5 
 
 		 381 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  27.5 
 
 		 381 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.5 
 
 		 381 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  27.22 
 
 		 588 aa  43.5  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.81 
 
 		 381 aa  43.5  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3660  putative alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 		 555 aa  43.1  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  25.67 
 
 		 570 aa  43.1  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>