66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1848 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1848  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 419 aa  861    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  30.45 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  28.3 
 
 		 434 aa  163  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2376  Pyrrolo-quinoline quinone  28.64 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  27.1 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  26.17 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  25.58 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1863  Pyrrolo-quinoline quinone  28.08 
 
 		 462 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4240  Pyrrolo-quinoline quinone  32.25 
 
 		 490 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00516774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  23.51 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  22.6 
 
 		 934 aa  84  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4033  Pyrrolo-quinoline quinone  23.24 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0221  Pyrrolo-quinoline quinone  25.99 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0598  Pyrrolo-quinoline quinone  24.23 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118149  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  24.01 
 
 		 484 aa  66.6  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1978  hypothetical protein  26.97 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2943  Pyrrolo-quinoline quinone  21.36 
 
 		 593 aa  62.4  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  24.83 
 
 		 611 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  22.28 
 
 		 1311 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  22.36 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  25.41 
 
 		 448 aa  57  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  28.39 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  23.46 
 
 		 774 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  23.86 
 
 		 475 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.2 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4007  hypothetical protein  24.18 
 
 		 608 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2733  hypothetical protein  25.1 
 
 		 530 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.735957  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  27.27 
 
 		 583 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  24.75 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.9 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  28.83 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  21.67 
 
 		 463 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  28 
 
 		 582 aa  47  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.92 
 
 		 393 aa  46.6  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  22.62 
 
 		 795 aa  46.6  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.92 
 
 		 393 aa  46.6  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0750  PQQ repeat-containing protein  21.61 
 
 		 353 aa  46.6  0.0008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.137969  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  22.88 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.9 
 
 		 597 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  26.22 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  20.75 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  25.13 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.92 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.27 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  35.23 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0726  Pyrrolo-quinoline quinone  30.63 
 
 		 549 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0623502 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1327  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  24 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  23.35 
 
 		 687 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  22.76 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.83 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  22.05 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  31.3 
 
 		 580 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.01 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  26 
 
 		 591 aa  43.5  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.13 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  22.47 
 
 		 448 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  26.85 
 
 		 595 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.05 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  23.49 
 
 		 365 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  26.85 
 
 		 595 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  19.86 
 
 		 393 aa  43.5  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.31 
 
 		 584 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.08 
 
 		 386 aa  43.1  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.31 
 
 		 584 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  23.14 
 
 		 652 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  22.73 
 
 		 556 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>