68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1628 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  100 
 
 
820 aa  1694    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  39.65 
 
 
789 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4188  peptidase C1A papain  33.56 
 
 
599 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  33.87 
 
 
535 aa  132  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04739  cysteine protease  29.36 
 
 
270 aa  94.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04730  cysteine protease  29.52 
 
 
312 aa  89.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0404654  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0145  hypothetical protein  30.04 
 
 
712 aa  89.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  24.41 
 
 
487 aa  88.2  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  26.71 
 
 
1628 aa  87.8  8e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  25 
 
 
1242 aa  84.7  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  28.11 
 
 
1332 aa  77.8  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  31.58 
 
 
718 aa  77.8  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  27.27 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  26.94 
 
 
271 aa  77.4  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  26.54 
 
 
494 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3515  peptidase C1A papain  25.89 
 
 
307 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.071303  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  37.74 
 
 
814 aa  72  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  25 
 
 
255 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  25 
 
 
255 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  25.55 
 
 
323 aa  64.7  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  27.13 
 
 
303 aa  61.6  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  23.24 
 
 
407 aa  62  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  28.3 
 
 
812 aa  61.6  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  27.16 
 
 
307 aa  61.6  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  25.82 
 
 
272 aa  61.2  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  26.43 
 
 
268 aa  60.8  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  27.12 
 
 
307 aa  60.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  26.92 
 
 
308 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  28.14 
 
 
497 aa  60.1  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  21.82 
 
 
477 aa  59.7  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  27.31 
 
 
688 aa  59.3  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  23.55 
 
 
395 aa  58.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  25.66 
 
 
305 aa  58.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  28.5 
 
 
1202 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  25 
 
 
284 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  25.53 
 
 
1066 aa  57  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  39.34 
 
 
354 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  26.5 
 
 
496 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  25.94 
 
 
450 aa  55.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  24.87 
 
 
901 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  26.92 
 
 
688 aa  55.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  26.02 
 
 
934 aa  55.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  21.46 
 
 
870 aa  53.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  25.42 
 
 
934 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  27.9 
 
 
725 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  29.09 
 
 
426 aa  50.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  23.12 
 
 
795 aa  47.8  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3105  Pyrrolo-quinoline quinone  27.53 
 
 
453 aa  47  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  25.17 
 
 
440 aa  47.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  27.92 
 
 
380 aa  47.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  24.72 
 
 
753 aa  47.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  32.18 
 
 
368 aa  46.2  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.45 
 
 
381 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1978  hypothetical protein  24.34 
 
 
489 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  25.82 
 
 
381 aa  46.2  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  25.82 
 
 
381 aa  46.2  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  32.33 
 
 
1454 aa  45.8  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  26.54 
 
 
372 aa  46.2  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  21.84 
 
 
453 aa  45.4  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  25.93 
 
 
381 aa  45.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  26.2 
 
 
1236 aa  44.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.22 
 
 
380 aa  44.7  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  23.99 
 
 
1328 aa  44.3  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  23.51 
 
 
556 aa  44.7  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0849  Pyrrolo-quinoline quinone  25.9 
 
 
528 aa  44.7  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  32.89 
 
 
379 aa  44.3  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.45 
 
 
350 aa  44.3  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  25.45 
 
 
381 aa  44.3  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>