249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3412 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
402 aa  798    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  32.75 
 
 
382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  29.81 
 
 
415 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 
795 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  28.54 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  31.84 
 
 
963 aa  116  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  30.9 
 
 
431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  32.01 
 
 
463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  37.55 
 
 
1454 aa  106  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  28.17 
 
 
352 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  29.39 
 
 
475 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  25.82 
 
 
1812 aa  93.2  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  27.66 
 
 
653 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 
774 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  27.72 
 
 
705 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  26.22 
 
 
445 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 
652 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  33.49 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 
687 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  25.18 
 
 
603 aa  83.6  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  27.45 
 
 
1682 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  24.47 
 
 
603 aa  80.9  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  25.17 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  26.97 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  31.21 
 
 
484 aa  80.5  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  26.21 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  27.84 
 
 
450 aa  79.7  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  27.53 
 
 
445 aa  79.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  24.32 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  27.87 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  28.97 
 
 
438 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  29.21 
 
 
422 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  24.55 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  24.1 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  27.34 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  24.02 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  26.48 
 
 
457 aa  70.5  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  25.5 
 
 
611 aa  69.7  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  31.25 
 
 
616 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  22.54 
 
 
611 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  27.38 
 
 
901 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  23.91 
 
 
656 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  24.74 
 
 
797 aa  66.2  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  24.47 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  32.22 
 
 
400 aa  66.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  32.22 
 
 
400 aa  66.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  27.84 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  29.3 
 
 
426 aa  64.3  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  26.09 
 
 
514 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.4 
 
 
402 aa  63.2  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  26.74 
 
 
440 aa  63.2  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  27.97 
 
 
439 aa  63.2  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  27.13 
 
 
454 aa  63.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2199  Pyrrolo-quinoline quinone  30.24 
 
 
447 aa  63.2  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  29.96 
 
 
1328 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  30.13 
 
 
2036 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  30.13 
 
 
1969 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  27.46 
 
 
556 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  24.56 
 
 
324 aa  62  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  27.57 
 
 
384 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  29.96 
 
 
1241 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.78 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  27.1 
 
 
384 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  25.34 
 
 
643 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  25.21 
 
 
619 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  26.26 
 
 
392 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3619  Pyrrolo-quinoline quinone  34.59 
 
 
581 aa  60.1  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  30.29 
 
 
451 aa  60.1  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  24.72 
 
 
1067 aa  60.1  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  25.09 
 
 
809 aa  60.1  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 
861 aa  59.7  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  26.39 
 
 
1311 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.51 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.39 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  24.89 
 
 
396 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  24.81 
 
 
453 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  30.05 
 
 
395 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  28.5 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  24.64 
 
 
448 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3316  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  27.09 
 
 
545 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1144  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  26.09 
 
 
391 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.05 
 
 
395 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  23.96 
 
 
399 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2069  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  24.71 
 
 
407 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3410  Pyrrolo-quinoline quinone  29.31 
 
 
398 aa  58.9  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  26.24 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  26.24 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.98 
 
 
392 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1209  WD40-like protein repeat-like protein  28.57 
 
 
446 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.415141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.55 
 
 
393 aa  57.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  26.42 
 
 
422 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0750  PQQ repeat-containing protein  22.48 
 
 
353 aa  57.4  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.137969  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  25.49 
 
 
381 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4195  Pyrrolo-quinoline quinone  28.52 
 
 
404 aa  57.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  24.64 
 
 
454 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  31.38 
 
 
349 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  27.07 
 
 
440 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  25.21 
 
 
448 aa  57.4  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  26.92 
 
 
389 aa  57.4  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  27.84 
 
 
475 aa  57  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>