141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1236 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  97.01 
 
 		 603 aa  1152    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 603 aa  1219    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  25.74 
 
 		 687 aa  100  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 		 652 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  28.13 
 
 		 653 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  25.56 
 
 		 322 aa  94  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  25.47 
 
 		 2122 aa  93.2  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  25.32 
 
 		 322 aa  93.6  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  25.24 
 
 		 322 aa  92.8  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  24.92 
 
 		 324 aa  92.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1682 aa  90.9  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  26.15 
 
 		 774 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  25.52 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  26.07 
 
 		 457 aa  83.2  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0591  hypothetical protein  36.09 
 
 		 613 aa  82.8  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 		 475 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  25.38 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  29.13 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  28.96 
 
 		 1812 aa  79  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  22.98 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  27.13 
 
 		 546 aa  78.2  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  25.98 
 
 		 486 aa  77  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  25.94 
 
 		 432 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  25.72 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1890  Pyrrolo-quinoline quinone  22.95 
 
 		 552 aa  73.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  26.17 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  22.66 
 
 		 795 aa  70.9  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  24.61 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  24.56 
 
 		 1454 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  24.74 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  23.89 
 
 		 611 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  23.98 
 
 		 963 aa  62.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  21.38 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  21.38 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  24.6 
 
 		 616 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  22.27 
 
 		 705 aa  61.2  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 		 619 aa  60.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  23.25 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  22.71 
 
 		 643 aa  58.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0990  Pyrrolo-quinoline quinone  24.38 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  24.23 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.61 
 
 		 411 aa  55.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  22.65 
 
 		 556 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  25.79 
 
 		 386 aa  54.7  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  19.36 
 
 		 391 aa  54.3  0.000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0619  Pyrrolo-quinoline quinone  21.05 
 
 		 373 aa  53.9  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.051105  hitchhiker  0.000000261187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  22.02 
 
 		 396 aa  53.9  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  24.31 
 
 		 534 aa  53.9  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  24.43 
 
 		 382 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  24.23 
 
 		 389 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  23.9 
 
 		 861 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.66 
 
 		 392 aa  52  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  23.58 
 
 		 371 aa  51.6  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  22.76 
 
 		 384 aa  51.6  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  22.76 
 
 		 384 aa  51.2  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.3 
 
 		 392 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.41 
 
 		 395 aa  50.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  26.88 
 
 		 379 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.2 
 
 		 392 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.2 
 
 		 392 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  23.56 
 
 		 363 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0685  hypothetical protein  23.68 
 
 		 387 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000893693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  22.66 
 
 		 372 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.78 
 
 		 395 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  22.97 
 
 		 797 aa  49.7  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  31.13 
 
 		 371 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0794  WD-40 repeat-containing protein  24.26 
 
 		 408 aa  49.3  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.56 
 
 		 393 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  23.19 
 
 		 383 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.77 
 
 		 393 aa  49.7  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.95 
 
 		 393 aa  49.3  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.62 
 
 		 380 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.56 
 
 		 393 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 392 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 392 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 392 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  23.56 
 
 		 363 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 392 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  21.92 
 
 		 374 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  20.33 
 
 		 392 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  23.25 
 
 		 2036 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  23.25 
 
 		 1969 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  25 
 
 		 611 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  24.26 
 
 		 454 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0893  Pyrrolo-quinoline quinone  24.7 
 
 		 645 aa  48.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  22.51 
 
 		 454 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  22.57 
 
 		 448 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  22.75 
 
 		 444 aa  47.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  24.55 
 
 		 834 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  29.77 
 
 		 392 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.77 
 
 		 392 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  31.13 
 
 		 371 aa  47.4  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.77 
 
 		 392 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.77 
 
 		 392 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.77 
 
 		 392 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  29.77 
 
 		 392 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.77 
 
 		 392 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0655  Pyrrolo-quinoline quinone  25.11 
 
 		 402 aa  47  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.808652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>