164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1297 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
322 aa  642    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  94.72 
 
 
322 aa  617  1e-176  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  94.1 
 
 
322 aa  614  1e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  75.47 
 
 
324 aa  503  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  45.86 
 
 
1682 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  47.78 
 
 
2122 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  48.79 
 
 
486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  37.05 
 
 
440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  36.42 
 
 
431 aa  186  6e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.99 
 
 
1383 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  36.49 
 
 
415 aa  180  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  36.64 
 
 
463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  36.5 
 
 
352 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  35.62 
 
 
963 aa  169  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  29.18 
 
 
546 aa  153  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  34.66 
 
 
432 aa  148  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 
652 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  31.02 
 
 
687 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  29.81 
 
 
653 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  30.74 
 
 
475 aa  136  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  29.19 
 
 
423 aa  133  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 
774 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  28.78 
 
 
484 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  32.29 
 
 
457 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  34.29 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  32.47 
 
 
1454 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 
795 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  32.61 
 
 
371 aa  95.9  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  26.12 
 
 
603 aa  92.8  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  30.97 
 
 
450 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  26.18 
 
 
611 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  30.11 
 
 
371 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  25.2 
 
 
901 aa  89  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  25.37 
 
 
603 aa  89  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  31.3 
 
 
371 aa  87  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  28.14 
 
 
514 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  26.46 
 
 
861 aa  87  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  25.71 
 
 
365 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  26.84 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  23.34 
 
 
487 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  29.87 
 
 
1812 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  26.65 
 
 
439 aa  82.8  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  25.59 
 
 
374 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  23.2 
 
 
619 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  26.91 
 
 
455 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.08 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  25.08 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  27.64 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2877  WD40 repeat, subgroup  23.81 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.01664  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  28.04 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  26.2 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  24.81 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  25.17 
 
 
402 aa  72  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1743  hypothetical protein  25.31 
 
 
407 aa  67  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2345  Pyrrolo-quinoline quinone  23.03 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  22.76 
 
 
705 aa  66.2  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  20.59 
 
 
611 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 
363 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  24.78 
 
 
848 aa  62.8  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 
363 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  24.4 
 
 
383 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  28.76 
 
 
534 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0893  Pyrrolo-quinoline quinone  25.57 
 
 
645 aa  61.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  24.66 
 
 
469 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4046  hypothetical protein  25.56 
 
 
624 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00161846  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7435  hypothetical protein  25.56 
 
 
624 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  26.02 
 
 
389 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  22.94 
 
 
834 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2728  hypothetical protein  27.11 
 
 
384 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.402886 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  23.93 
 
 
438 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  25.68 
 
 
363 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  19.65 
 
 
643 aa  56.2  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  25.2 
 
 
466 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  24.32 
 
 
656 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4255  Pyrrolo-quinoline quinone  27.31 
 
 
630 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0619  Pyrrolo-quinoline quinone  22.36 
 
 
373 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.051105  hitchhiker  0.000000261187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.49 
 
 
393 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  26.77 
 
 
402 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0883  Pyrrolo-quinoline quinone  21.65 
 
 
442 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0722286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  24.43 
 
 
2036 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0794  WD-40 repeat-containing protein  21.82 
 
 
408 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.71 
 
 
392 aa  53.5  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  24.43 
 
 
1969 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  24.54 
 
 
616 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4195  Pyrrolo-quinoline quinone  25.22 
 
 
404 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3015  Pyrrolo-quinoline quinone  24.89 
 
 
416 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.18 
 
 
407 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  23.94 
 
 
2272 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3315  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  26.92 
 
 
557 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  25.21 
 
 
389 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  25.76 
 
 
349 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4265  Pyrrolo-quinoline quinone  35.59 
 
 
429 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494797  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.82 
 
 
407 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  29.31 
 
 
400 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  29.31 
 
 
400 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  23.68 
 
 
809 aa  50.1  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.88 
 
 
392 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  24.54 
 
 
417 aa  49.7  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  22.84 
 
 
387 aa  50.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  24.7 
 
 
797 aa  49.7  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>