83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3316 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3316  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  100 
 
 
545 aa  1051    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3315  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  52.68 
 
 
557 aa  434  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2569  Pyrrolo-quinoline quinone  51.91 
 
 
531 aa  396  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3619  Pyrrolo-quinoline quinone  32.19 
 
 
581 aa  158  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0204  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  31.21 
 
 
555 aa  126  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2034  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  29.79 
 
 
578 aa  98.6  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1394  Pyrrolo-quinoline quinone  25.59 
 
 
471 aa  74.7  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  36.65 
 
 
431 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  40.18 
 
 
457 aa  62.4  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  32.98 
 
 
1454 aa  62  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  26.2 
 
 
463 aa  61.6  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  26.69 
 
 
901 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  37.06 
 
 
438 aa  60.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  28.05 
 
 
963 aa  57.4  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  30.54 
 
 
1812 aa  54.7  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 
422 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  25.06 
 
 
386 aa  53.5  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  28.75 
 
 
422 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0883  Pyrrolo-quinoline quinone  28.64 
 
 
442 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0722286  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  26.53 
 
 
395 aa  53.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  23.58 
 
 
445 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  26.67 
 
 
402 aa  52.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.06 
 
 
381 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.92 
 
 
392 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2689  Pyrrolo-quinoline quinone  27.88 
 
 
392 aa  51.2  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.862055  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.98 
 
 
391 aa  50.8  0.00006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.57 
 
 
393 aa  50.4  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.98 
 
 
737 aa  50.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1500  Pyrrolo-quinoline quinone  25.29 
 
 
407 aa  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0717216  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  30.53 
 
 
349 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  28.89 
 
 
475 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.92 
 
 
392 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  22.37 
 
 
407 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  25.28 
 
 
454 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  20.81 
 
 
442 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.92 
 
 
392 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.57 
 
 
393 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.57 
 
 
392 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.31 
 
 
392 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.31 
 
 
392 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  32.56 
 
 
423 aa  48.9  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.31 
 
 
392 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.31 
 
 
392 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  28.31 
 
 
392 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  29 
 
 
402 aa  48.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  30.12 
 
 
417 aa  48.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  28.31 
 
 
392 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.31 
 
 
392 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.31 
 
 
392 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.31 
 
 
392 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  27.06 
 
 
450 aa  48.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  26.12 
 
 
809 aa  47.4  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  27.12 
 
 
861 aa  47.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  31.01 
 
 
372 aa  47  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.31 
 
 
392 aa  47.4  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  26.15 
 
 
382 aa  47  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.95 
 
 
393 aa  47  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  29.65 
 
 
365 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  26.53 
 
 
716 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  27.01 
 
 
795 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  26.27 
 
 
705 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
616 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
687 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.95 
 
 
393 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4033  Pyrrolo-quinoline quinone  30.77 
 
 
431 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  25.79 
 
 
371 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  30.91 
 
 
352 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  23.82 
 
 
432 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.95 
 
 
393 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.98 
 
 
393 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  26.75 
 
 
575 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  25.21 
 
 
727 aa  45.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  31.78 
 
 
400 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  33.06 
 
 
534 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.5 
 
 
393 aa  44.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  26.61 
 
 
371 aa  44.3  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  27.86 
 
 
653 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  27.75 
 
 
611 aa  44.3  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.17 
 
 
380 aa  44.3  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  30.58 
 
 
415 aa  43.9  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  28 
 
 
458 aa  43.9  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  31.78 
 
 
1241 aa  43.9  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0990  Pyrrolo-quinoline quinone  25.53 
 
 
441 aa  43.5  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>