More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1041 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  100 
 
 		 371 aa  741    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  94.61 
 
 		 371 aa  714    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  87.6 
 
 		 371 aa  647    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  31.64 
 
 		 687 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  28.69 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  35.78 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  32.22 
 
 		 432 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  30.1 
 
 		 475 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 		 795 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 		 774 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  29.43 
 
 		 352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  27.96 
 
 		 484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  33.18 
 
 		 652 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  32.02 
 
 		 653 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  29.43 
 
 		 963 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  28.76 
 
 		 423 aa  112  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  32.39 
 
 		 415 aa  106  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  24.65 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  32 
 
 		 611 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  29.81 
 
 		 1454 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  29.54 
 
 		 901 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  30.43 
 
 		 514 aa  96.3  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  32.61 
 
 		 322 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  32.1 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  32.17 
 
 		 322 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  27.76 
 
 		 457 aa  94.4  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  32.17 
 
 		 322 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  25.45 
 
 		 445 aa  90.9  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  30.67 
 
 		 616 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  21.8 
 
 		 396 aa  86.7  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  29.26 
 
 		 450 aa  86.7  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  29.51 
 
 		 2122 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1682 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  29.17 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  26.33 
 
 		 1812 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.36 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  24.36 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  25.21 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  25.99 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  25.63 
 
 		 643 aa  79.7  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  22.44 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  27.69 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.81 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 		 611 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  22.36 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  24.29 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4195  Pyrrolo-quinoline quinone  27.22 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  28.35 
 
 		 797 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  26.07 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  33.71 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  23.14 
 
 		 619 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  29.96 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  25.99 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  24.21 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  25.99 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.89 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2894  Pyrrolo-quinoline quinone  27.39 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0786698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  30.23 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  24.25 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  26.67 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  21.52 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  28.86 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.01 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  29.35 
 
 		 1328 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  23.41 
 
 		 448 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  30.06 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.55 
 
 		 393 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  27.78 
 
 		 1241 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  31.64 
 
 		 534 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  23.41 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  23.83 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  24.42 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.37 
 
 		 1383 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  26.67 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  28.27 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.48 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 		 861 aa  71.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.59 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.59 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  24.7 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.59 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.59 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.34 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  25.37 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  25.37 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.37 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.48 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.51 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.37 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.37 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  31.76 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.44 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  31.76 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.37 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.59 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  23.83 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  25.7 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  23.96 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  25.46 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>