187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2894 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2894  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
406 aa  819    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0786698  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  25.89 
 
 
432 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  31.44 
 
 
963 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  28.92 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  25.77 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  25.35 
 
 
463 aa  76.3  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  27.39 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  25.06 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  27.08 
 
 
1454 aa  73.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
795 aa  73.6  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.26 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  28.19 
 
 
457 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  28.92 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  25.99 
 
 
484 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.87 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.26 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.62 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.87 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.98 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.87 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  22 
 
 
475 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  26.37 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  24.87 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.71 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  27.78 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  24.23 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.23 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  25.39 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  24.23 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  23.19 
 
 
445 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.23 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.23 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.23 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.77 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  24.93 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.23 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.43 
 
 
392 aa  64.7  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.23 
 
 
392 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  27.87 
 
 
901 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  28.53 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  23.15 
 
 
774 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.04 
 
 
393 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  23.77 
 
 
1812 aa  61.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  25.66 
 
 
415 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  23.4 
 
 
687 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  20.98 
 
 
611 aa  59.7  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1144  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  25.94 
 
 
391 aa  59.7  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  29.66 
 
 
363 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  25.31 
 
 
653 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  29.66 
 
 
363 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  25.67 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.6 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  31.51 
 
 
451 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  29.26 
 
 
363 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  28.96 
 
 
438 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  24.03 
 
 
705 aa  57.4  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  21.13 
 
 
407 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  23.37 
 
 
372 aa  57  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  21.74 
 
 
384 aa  57  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  22.75 
 
 
389 aa  56.6  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 
861 aa  56.6  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  22.07 
 
 
384 aa  56.6  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  24.18 
 
 
387 aa  56.6  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  21.37 
 
 
374 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  30.48 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  26.35 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.48 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1209  WD40-like protein repeat-like protein  27.78 
 
 
446 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.415141  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  27.65 
 
 
450 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  27.08 
 
 
383 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  23.03 
 
 
652 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  21.86 
 
 
458 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1327  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  30.88 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3410  Pyrrolo-quinoline quinone  24.91 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.7 
 
 
402 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.84 
 
 
386 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0667  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.81 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  27.46 
 
 
1241 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  26.92 
 
 
426 aa  53.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  27.46 
 
 
1328 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  28.22 
 
 
388 aa  53.5  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  29.87 
 
 
455 aa  53.1  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  23.27 
 
 
440 aa  53.1  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  23.97 
 
 
439 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  28.21 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.58 
 
 
385 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  25.68 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  23.05 
 
 
616 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.78 
 
 
386 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  26.55 
 
 
534 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2199  Pyrrolo-quinoline quinone  26.16 
 
 
447 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.35 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  26.67 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.26 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  21.29 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  26.55 
 
 
2036 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  25.15 
 
 
809 aa  50.8  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>