291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0923 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  87.6 
 
 		 371 aa  668    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  89.76 
 
 		 371 aa  673    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 371 aa  741    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  26.81 
 
 		 431 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  33.96 
 
 		 463 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 		 795 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  28.73 
 
 		 687 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  29.71 
 
 		 432 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  26.6 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 		 475 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  29.54 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  26.62 
 
 		 774 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  26.92 
 
 		 423 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 		 963 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  30.26 
 
 		 653 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  30.45 
 
 		 652 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  26.4 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  24.08 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  32 
 
 		 611 aa  96.3  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  32.17 
 
 		 324 aa  91.3  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  25.81 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  24.85 
 
 		 450 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  29.47 
 
 		 514 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  30.73 
 
 		 616 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  32.6 
 
 		 1454 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  31.74 
 
 		 322 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  27.73 
 
 		 901 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  32.82 
 
 		 322 aa  86.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  30.87 
 
 		 322 aa  86.3  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  30.43 
 
 		 2122 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.75 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  25.08 
 
 		 1812 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  23.21 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  32.47 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  23.02 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.01 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.07 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  26.03 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  24.56 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  22.39 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.01 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1682 aa  75.9  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  28.15 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.93 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.15 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  25.75 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.83 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  23.14 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.65 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  28.33 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  27.56 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  25.74 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  25.81 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  23.84 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  22.22 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  22.92 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  24.54 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  24.65 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  23.49 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  24.54 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  23.17 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  23.91 
 
 		 643 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  24.5 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.55 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  25.32 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  23.42 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.61 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 		 861 aa  70.5  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  29.75 
 
 		 1328 aa  70.1  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.87 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.83 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  22.62 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.26 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.55 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.55 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.42 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  23.94 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0884  Pyrrolo-quinoline quinone  26.58 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0837922  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  29.75 
 
 		 1241 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  22.22 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.08 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.07 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  29.22 
 
 		 705 aa  68.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2894  Pyrrolo-quinoline quinone  26.37 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0786698  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  31.46 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.53 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  22.22 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4195  Pyrrolo-quinoline quinone  23.5 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  29.81 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  22.27 
 
 		 619 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.03 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  26.37 
 
 		 372 aa  67  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  23.59 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  23.02 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  23.59 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.18 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  21.36 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  25.65 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  23.39 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  27.16 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>