229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1692 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
534 aa  1053    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  23.94 
 
 
445 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  31.5 
 
 
484 aa  110  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 
687 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
774 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  28.81 
 
 
431 aa  99.8  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  25.34 
 
 
432 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  25.42 
 
 
475 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  30.06 
 
 
457 aa  88.6  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 
963 aa  87.4  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  24.5 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 
795 aa  83.6  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  28.96 
 
 
415 aa  83.2  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  24.04 
 
 
652 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  28.07 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  23.84 
 
 
653 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  26.04 
 
 
514 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  29.5 
 
 
439 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  25.93 
 
 
463 aa  75.5  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  30.09 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  28.33 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  27.82 
 
 
1682 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  30.96 
 
 
1454 aa  72.8  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  29.63 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  26.29 
 
 
2122 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  26.48 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 
861 aa  68.2  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  23.89 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  27.46 
 
 
450 aa  67.4  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  23.96 
 
 
611 aa  67  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.36 
 
 
402 aa  67  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  25.45 
 
 
469 aa  66.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  26.07 
 
 
1812 aa  65.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  24.18 
 
 
396 aa  65.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  28.1 
 
 
379 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  30.1 
 
 
450 aa  64.3  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.34 
 
 
395 aa  64.3  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.09 
 
 
411 aa  63.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.18 
 
 
393 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  25.6 
 
 
411 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  22.98 
 
 
374 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  29.52 
 
 
322 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  26.56 
 
 
389 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  30.04 
 
 
444 aa  61.6  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 
393 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  27.4 
 
 
382 aa  61.6  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  29.34 
 
 
384 aa  61.6  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 
393 aa  60.8  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  28.76 
 
 
322 aa  60.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  25.96 
 
 
322 aa  60.5  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.18 
 
 
386 aa  60.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  27.31 
 
 
386 aa  60.5  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.92 
 
 
395 aa  60.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  26.92 
 
 
395 aa  60.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.21 
 
 
393 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  29 
 
 
400 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.91 
 
 
395 aa  58.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  26.83 
 
 
438 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  27.57 
 
 
387 aa  58.2  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  26.07 
 
 
402 aa  58.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  25.34 
 
 
445 aa  58.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  25.84 
 
 
616 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 
400 aa  57.4  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  28.3 
 
 
384 aa  57.4  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 
400 aa  57.4  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  27.83 
 
 
384 aa  57  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.9 
 
 
392 aa  57  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  25.2 
 
 
372 aa  56.6  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0750  PQQ repeat-containing protein  21.56 
 
 
353 aa  55.8  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.137969  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
546 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  26.78 
 
 
381 aa  55.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  25.42 
 
 
363 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  26.44 
 
 
475 aa  55.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  25.08 
 
 
363 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.14 
 
 
392 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.14 
 
 
392 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.14 
 
 
392 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3570  Pyrrolo-quinoline quinone  23.78 
 
 
451 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  27.27 
 
 
417 aa  55.1  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  26.76 
 
 
458 aa  54.7  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.97 
 
 
1383 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  25.54 
 
 
412 aa  54.7  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  39.47 
 
 
579 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.14 
 
 
392 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  28.85 
 
 
372 aa  54.3  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  25.76 
 
 
395 aa  53.9  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  24.42 
 
 
603 aa  54.3  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  25.76 
 
 
395 aa  53.9  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.14 
 
 
392 aa  53.9  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  23.14 
 
 
603 aa  54.3  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.47 
 
 
385 aa  53.9  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.14 
 
 
392 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  23.56 
 
 
486 aa  53.9  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  28 
 
 
381 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  24.94 
 
 
455 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
643 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  27.16 
 
 
436 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 
395 aa  53.5  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  27.08 
 
 
444 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  25.2 
 
 
386 aa  52.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>