286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1729 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
372 aa  708    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  24.27 
 
 
475 aa  93.2  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 
774 aa  89.4  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  25.9 
 
 
687 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  33.12 
 
 
1454 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  27.07 
 
 
463 aa  87.4  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 
963 aa  87  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  28.25 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  27.81 
 
 
431 aa  84  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  27.43 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.22 
 
 
393 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 
652 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.92 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  25.69 
 
 
653 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  35.56 
 
 
901 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.45 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.45 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.45 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.45 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  31.3 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  31.3 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.3 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.3 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.13 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.3 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.3 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.42 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.87 
 
 
392 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.05 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  25.71 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  32 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  32.22 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  25.69 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  32 
 
 
611 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  26.52 
 
 
514 aa  73.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  28.86 
 
 
371 aa  72.8  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  27.75 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  24 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.45 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.37 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.17 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  29.17 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.17 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  28.11 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.74 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  23.22 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.5 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.93 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.36 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.93 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.93 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  23.22 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  31.18 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.32 
 
 
415 aa  67  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  28.45 
 
 
450 aa  67  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.9 
 
 
393 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  24.59 
 
 
389 aa  67  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  26.37 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  31.05 
 
 
415 aa  67  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  31.45 
 
 
484 aa  66.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  30.9 
 
 
400 aa  66.2  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  29.25 
 
 
611 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  30.52 
 
 
395 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.48 
 
 
414 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  28.26 
 
 
705 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  25.83 
 
 
795 aa  65.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  26.5 
 
 
382 aa  64.3  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  25.59 
 
 
412 aa  63.9  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  29.02 
 
 
619 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  27.8 
 
 
365 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1323  Pyrrolo-quinoline quinone  31.3 
 
 
639 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  29.17 
 
 
380 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  25.23 
 
 
396 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  29.72 
 
 
397 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  29.11 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  28.16 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  28.27 
 
 
387 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  30.8 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  30.91 
 
 
384 aa  60.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  32 
 
 
458 aa  60.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.52 
 
 
386 aa  60.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  31.48 
 
 
380 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  27.31 
 
 
384 aa  60.1  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  29.61 
 
 
445 aa  59.7  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  29.75 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  24.9 
 
 
616 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0804  Pyrrolo-quinoline quinone  28.44 
 
 
536 aa  58.9  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  27.94 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  33.56 
 
 
450 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  26.56 
 
 
455 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  30.25 
 
 
384 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.74 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0980  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  23.22 
 
 
779 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.804184  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  27.46 
 
 
454 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.41 
 
 
380 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  31.71 
 
 
390 aa  57  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  25.59 
 
 
383 aa  56.6  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>