More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2056 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
705 aa  1411    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2054  serine/threonine protein kinase  40.66 
 
 
633 aa  156  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.647087  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  27.54 
 
 
431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  28.01 
 
 
463 aa  110  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3250  serine/threonine protein kinase  33.8 
 
 
941 aa  106  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.308767  normal  0.185977 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  28.3 
 
 
415 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2050  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
566 aa  105  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00637413  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  27.87 
 
 
795 aa  103  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  27.1 
 
 
352 aa  103  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 
963 aa  101  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3288  serine/threonine protein kinase  34.11 
 
 
488 aa  99  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.922418  normal  0.103144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  26.83 
 
 
382 aa  98.2  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  27.34 
 
 
475 aa  95.9  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1771  protein kinase  31.17 
 
 
425 aa  94.7  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  26.74 
 
 
653 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0446  serine/threonine protein kinase  32.67 
 
 
489 aa  91.7  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.496367  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  28.17 
 
 
457 aa  90.9  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  29.03 
 
 
1454 aa  90.1  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  27.31 
 
 
707 aa  89.7  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  25.33 
 
 
611 aa  88.2  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 
687 aa  87.4  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  29.9 
 
 
423 aa  87  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  28.94 
 
 
448 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3285  serine/threonine protein kinase  34.3 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0681087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  27.41 
 
 
514 aa  85.5  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  24.22 
 
 
652 aa  84.7  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3287  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
940 aa  84.3  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.092483 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  28.94 
 
 
454 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
681 aa  84  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  22.96 
 
 
774 aa  84  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  27.72 
 
 
402 aa  83.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0750  protein kinase  26.56 
 
 
671 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0831444  normal  0.845491 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  28.53 
 
 
454 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 
861 aa  82.4  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1254  serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 
522 aa  82  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  22.54 
 
 
1812 aa  81.6  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4114  serine/threonine protein kinase  28.03 
 
 
513 aa  81.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  24.69 
 
 
619 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  30.21 
 
 
625 aa  78.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0317  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 
529 aa  78.2  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.149015  normal  0.367206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  27.01 
 
 
484 aa  77.8  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3305  serine/threonine protein kinase  32.31 
 
 
844 aa  77.8  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.311881  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.06 
 
 
499 aa  77  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  26.8 
 
 
384 aa  76.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  26.46 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.05 
 
 
715 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  32.93 
 
 
568 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  26.12 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  27.57 
 
 
450 aa  75.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  28.75 
 
 
475 aa  75.5  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  24.05 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2994  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.27 
 
 
477 aa  75.5  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.460632  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1108  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.14 
 
 
806 aa  75.1  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.461598  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0794  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 
623 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.779291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0809  protein kinase  29.21 
 
 
623 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386876  normal  0.0684467 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.2 
 
 
1262 aa  75.1  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0789  protein kinase  29.21 
 
 
621 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  26.94 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  27.85 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1113  protein kinase  32.11 
 
 
620 aa  74.3  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273994  normal  0.0338435 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1265  serine/threonine protein kinase  30.91 
 
 
484 aa  74.3  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.29 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  26.37 
 
 
395 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  26.37 
 
 
395 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  26.13 
 
 
412 aa  73.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 
671 aa  73.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.89 
 
 
385 aa  72.8  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  25.65 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.3 
 
 
1044 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  31.7 
 
 
666 aa  72  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  24.71 
 
 
397 aa  72  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1172  protein kinase  28.73 
 
 
451 aa  72  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.190918  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  29.44 
 
 
1167 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1872  serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 
534 aa  71.2  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.589962  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3488  serine/threonine protein kinase  27.76 
 
 
524 aa  71.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.562336  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  27.38 
 
 
692 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5516  serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 
512 aa  71.2  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262851  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  26.9 
 
 
869 aa  70.9  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2186  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.88 
 
 
610 aa  70.9  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5635  protein kinase  28.52 
 
 
467 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 
683 aa  70.5  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3239  Heat shock protein 70  31.34 
 
 
1158 aa  70.5  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.573429  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  26.39 
 
 
445 aa  70.1  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 
641 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3400  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.16 
 
 
1373 aa  70.1  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.74 
 
 
391 aa  70.5  0.0000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1394  serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 
790 aa  70.5  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0641845  normal  0.195915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.45 
 
 
415 aa  70.1  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  28.11 
 
 
691 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 
439 aa  70.1  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 
763 aa  70.5  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6706  serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 
664 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0848687  normal  0.105992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 
894 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  28.76 
 
 
901 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 
450 aa  69.7  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  27.52 
 
 
450 aa  69.7  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.62 
 
 
650 aa  69.7  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 
861 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.78 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>