More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1872 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1872  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
534 aa  1078    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.589962  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0750  protein kinase  44.83 
 
 
671 aa  212  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0831444  normal  0.845491 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  40.07 
 
 
707 aa  211  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1771  protein kinase  39.16 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0317  serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 
529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.149015  normal  0.367206 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2667  serine/threonine protein kinase  35.5 
 
 
417 aa  154  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  35.61 
 
 
582 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 
368 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.19 
 
 
863 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 
613 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.46 
 
 
647 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  32.61 
 
 
612 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
615 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.2 
 
 
681 aa  113  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 
468 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  32.96 
 
 
700 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.97 
 
 
715 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.53 
 
 
613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  33.46 
 
 
597 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf717  serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 
332 aa  111  3e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  34.91 
 
 
573 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 
624 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 
624 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  32.27 
 
 
625 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 
624 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  32.27 
 
 
625 aa  110  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.6 
 
 
520 aa  109  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  31.58 
 
 
667 aa  109  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3239  Heat shock protein 70  31.67 
 
 
1158 aa  109  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.573429  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  33.73 
 
 
626 aa  109  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.24 
 
 
880 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3291  serine/threonine protein kinase  32.51 
 
 
539 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.175689 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3287  serine/threonine protein kinase  33.73 
 
 
940 aa  109  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.092483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  30.85 
 
 
691 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.72 
 
 
627 aa  108  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  35.55 
 
 
776 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.98 
 
 
598 aa  108  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.59 
 
 
584 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.95 
 
 
603 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.55 
 
 
632 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  32.08 
 
 
668 aa  107  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  31.95 
 
 
681 aa  107  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3378  protein kinase  33.57 
 
 
544 aa  107  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.48624  decreased coverage  0.000240313 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  32.34 
 
 
625 aa  107  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  32.32 
 
 
618 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.56 
 
 
613 aa  106  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  35.55 
 
 
673 aa  106  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2716  serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 
919 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  34.36 
 
 
569 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.93 
 
 
645 aa  106  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  30.45 
 
 
690 aa  105  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  33.85 
 
 
1032 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  34.08 
 
 
763 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  29.77 
 
 
666 aa  104  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  30.07 
 
 
638 aa  104  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.93 
 
 
594 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 
681 aa  103  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  32.94 
 
 
758 aa  103  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  30.18 
 
 
604 aa  103  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.09 
 
 
607 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 
612 aa  103  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  32.58 
 
 
609 aa  103  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.83 
 
 
676 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 
707 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  33.85 
 
 
1032 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 
328 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  32.02 
 
 
1479 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3944  Serine/threonine protein kinase-like  28.62 
 
 
700 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.147415  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.14 
 
 
822 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3250  serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 
941 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.308767  normal  0.185977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  32.09 
 
 
325 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.09 
 
 
517 aa  101  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.4 
 
 
641 aa  101  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1473  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.93 
 
 
747 aa  101  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0818047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  31.53 
 
 
457 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3288  serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 
488 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.922418  normal  0.103144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.46 
 
 
700 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
691 aa  100  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  34.38 
 
 
1018 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  30.48 
 
 
614 aa  100  6e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 
963 aa  100  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 
795 aa  100  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 
666 aa  100  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5031  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
338 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3488  serine/threonine protein kinase  32.25 
 
 
524 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.562336  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0929  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
607 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0956  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
607 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  33.21 
 
 
661 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0491  serine/threonine protein kinase  31.14 
 
 
1070 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.424967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.6 
 
 
658 aa  99.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
761 aa  99  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  34.25 
 
 
889 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1722  cyclic nucleotide-binding protein  32.65 
 
 
454 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.107588  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  33.46 
 
 
736 aa  98.2  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0329  protein kinase  32.96 
 
 
615 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0711079  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  32.29 
 
 
790 aa  97.8  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
537 aa  97.8  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  32.69 
 
 
632 aa  98.2  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1859  predicted protein  29.15 
 
 
293 aa  97.4  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.297964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.71 
 
 
943 aa  97.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>