More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_3012 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
382 aa  766    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  33.52 
 
 
431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  33.24 
 
 
463 aa  146  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 
963 aa  139  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  32.27 
 
 
415 aa  139  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  32.77 
 
 
795 aa  135  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  32.75 
 
 
402 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  30.23 
 
 
774 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  33.64 
 
 
352 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  28.62 
 
 
432 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 
687 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  27.5 
 
 
475 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  31.76 
 
 
1454 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  28.36 
 
 
450 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  26.83 
 
 
705 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  27.51 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 
652 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  28.93 
 
 
653 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  28.69 
 
 
484 aa  90.5  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  29.03 
 
 
457 aa  90.5  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4195  Pyrrolo-quinoline quinone  27.22 
 
 
404 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  32.25 
 
 
438 aa  87  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  29.55 
 
 
901 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  27.67 
 
 
451 aa  85.9  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  27.78 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  29.12 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  27.1 
 
 
422 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  29.19 
 
 
1812 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  25.45 
 
 
1067 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  25.08 
 
 
445 aa  79.7  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  28.97 
 
 
1328 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  30.9 
 
 
2036 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  27.86 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  30.9 
 
 
1969 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  27.34 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  28 
 
 
1241 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  32.32 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  32.32 
 
 
363 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  27.19 
 
 
448 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  25.2 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  28.14 
 
 
797 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1327  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  27.76 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  28.01 
 
 
556 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  27.19 
 
 
454 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  26.2 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  28 
 
 
1300 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  24.84 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  22.82 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  25.54 
 
 
439 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  27.45 
 
 
2272 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  28.48 
 
 
611 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  26.2 
 
 
322 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  27.62 
 
 
514 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  28.69 
 
 
363 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  32.86 
 
 
458 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  24.86 
 
 
2122 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  23.72 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  28.78 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1290  Pyrrolo-quinoline quinone  26.95 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0582  Pyrrolo-quinoline quinone  33 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.812129  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  26.63 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  27.13 
 
 
616 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  25.46 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  29.46 
 
 
440 aa  67  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.17 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  35.62 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  24 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  25.07 
 
 
402 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.01 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  25.21 
 
 
809 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  26.01 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  24 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.57 
 
 
1383 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  25.42 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1209  WD40-like protein repeat-like protein  25 
 
 
446 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.415141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  33.61 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  26.5 
 
 
372 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  33.33 
 
 
380 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.61 
 
 
380 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  24.74 
 
 
384 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  25.83 
 
 
861 aa  64.3  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.57 
 
 
391 aa  63.9  0.000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 
380 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3240  Pyrrolo-quinoline quinone  23.17 
 
 
425 aa  64.3  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  24.21 
 
 
384 aa  63.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0160  Pyrrolo-quinoline quinone  27.62 
 
 
471 aa  63.5  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0726185  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  25.65 
 
 
453 aa  63.5  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  24.21 
 
 
475 aa  63.2  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  33.33 
 
 
389 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1394  Pyrrolo-quinoline quinone  31.47 
 
 
471 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  26.7 
 
 
383 aa  63.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  31.58 
 
 
455 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  25.08 
 
 
1682 aa  62.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  29.55 
 
 
372 aa  62.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.71 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  25.81 
 
 
389 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>