More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3456 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  100 
 
 		 1262 aa  2605    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  42.45 
 
 		 1363 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  39.44 
 
 		 1652 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  39.34 
 
 		 1163 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  40.73 
 
 		 1236 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  38.66 
 
 		 947 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  38.47 
 
 		 696 aa  422  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  36.25 
 
 		 1831 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  35.86 
 
 		 1523 aa  413  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  37 
 
 		 1454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 1221 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  39.18 
 
 		 1789 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  37.82 
 
 		 1510 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.38 
 
 		 1557 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.81 
 
 		 1686 aa  393  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.34 
 
 		 1481 aa  391  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  39.15 
 
 		 1553 aa  393  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  37.28 
 
 		 1364 aa  388  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  36.97 
 
 		 1217 aa  383  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  35.94 
 
 		 1193 aa  383  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2849  tyrosine protein kinase  48.29 
 
 		 975 aa  374  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.272735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  34.38 
 
 		 1188 aa  376  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  37.4 
 
 		 1357 aa  373  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  37.98 
 
 		 1443 aa  373  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  36.47 
 
 		 1552 aa  370  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  34.82 
 
 		 1196 aa  365  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  35.44 
 
 		 1367 aa  360  7e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  36.06 
 
 		 1474 aa  359  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  35.92 
 
 		 1229 aa  357  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.6 
 
 		 1598 aa  356  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  36.54 
 
 		 919 aa  354  5.9999999999999994e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.93 
 
 		 1760 aa  352  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.59 
 
 		 1711 aa  346  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.06 
 
 		 1609 aa  345  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  33.61 
 
 		 1247 aa  343  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.73 
 
 		 1868 aa  342  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.76 
 
 		 1583 aa  343  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  38.06 
 
 		 1656 aa  339  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  38.71 
 
 		 1661 aa  339  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  36.59 
 
 		 1211 aa  337  7e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.37 
 
 		 1607 aa  337  7.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  32.84 
 
 		 1190 aa  335  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.32 
 
 		 1626 aa  335  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  37.09 
 
 		 1714 aa  333  9e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.11 
 
 		 1547 aa  328  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.95 
 
 		 1623 aa  327  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  35.04 
 
 		 1416 aa  327  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  32.76 
 
 		 1901 aa  325  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.03 
 
 		 1684 aa  324  8e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.84 
 
 		 1617 aa  320  7.999999999999999e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  32.75 
 
 		 728 aa  319  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  29.73 
 
 		 1213 aa  318  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.21 
 
 		 1599 aa  317  8e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.44 
 
 		 930 aa  315  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  31.48 
 
 		 1807 aa  314  6.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  34.46 
 
 		 1176 aa  308  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  32.49 
 
 		 1208 aa  299  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  33.28 
 
 		 1161 aa  300  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.55 
 
 		 676 aa  298  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  25.37 
 
 		 1242 aa  298  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  32.64 
 
 		 1161 aa  289  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  33.39 
 
 		 1177 aa  289  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.07 
 
 		 1856 aa  286  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.68 
 
 		 924 aa  283  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  25.72 
 
 		 1330 aa  282  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  31.92 
 
 		 1348 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.54 
 
 		 1267 aa  279  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  31.86 
 
 		 1280 aa  275  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  31.16 
 
 		 1209 aa  274  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30 
 
 		 1823 aa  268  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  30.41 
 
 		 1766 aa  265  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  30.18 
 
 		 1304 aa  264  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  31.45 
 
 		 1344 aa  262  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.88 
 
 		 1205 aa  260  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  30.74 
 
 		 505 aa  259  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  30.47 
 
 		 1484 aa  258  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  32.35 
 
 		 1373 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  31.76 
 
 		 1858 aa  255  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  31.22 
 
 		 1411 aa  254  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  27.35 
 
 		 1209 aa  253  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  40.86 
 
 		 344 aa  253  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  28.55 
 
 		 1214 aa  252  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 		 687 aa  251  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  31.83 
 
 		 1164 aa  251  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  40.4 
 
 		 344 aa  250  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  26.99 
 
 		 1188 aa  245  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.55 
 
 		 1398 aa  244  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  31.59 
 
 		 608 aa  243  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  29.68 
 
 		 1491 aa  243  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  29.3 
 
 		 1016 aa  241  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  29.15 
 
 		 1016 aa  241  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  31.77 
 
 		 1311 aa  239  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  28.22 
 
 		 1399 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.53 
 
 		 740 aa  234  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  27.63 
 
 		 1190 aa  233  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  32.32 
 
 		 1878 aa  230  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.61 
 
 		 1039 aa  228  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.79 
 
 		 1004 aa  227  9e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.7 
 
 		 682 aa  226  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.29 
 
 		 1240 aa  225  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>