More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1807 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 1214 aa  2376    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  30.2 
 
 		 1163 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  30.89 
 
 		 1161 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  30.63 
 
 		 1161 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  29.42 
 
 		 1164 aa  456  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  30.19 
 
 		 1176 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  30.67 
 
 		 1209 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  29.23 
 
 		 1177 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  29.95 
 
 		 1190 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  35.69 
 
 		 1367 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  35.14 
 
 		 1523 aa  364  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  35.27 
 
 		 1510 aa  360  9.999999999999999e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  36.13 
 
 		 1553 aa  357  8.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.88 
 
 		 1481 aa  353  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  32.9 
 
 		 1831 aa  342  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  33.75 
 
 		 1454 aa  335  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  32.37 
 
 		 1229 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.53 
 
 		 1652 aa  323  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.56 
 
 		 1684 aa  317  6e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  37.17 
 
 		 696 aa  309  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  31.11 
 
 		 1236 aa  308  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  29.9 
 
 		 1363 aa  308  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  28.09 
 
 		 891 aa  304  6.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.28 
 
 		 1686 aa  304  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  32.25 
 
 		 1211 aa  302  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 1221 aa  302  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  31.74 
 
 		 1789 aa  301  7e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  29.48 
 
 		 1188 aa  300  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.69 
 
 		 1626 aa  298  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  33.77 
 
 		 1656 aa  293  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.36 
 
 		 1711 aa  292  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.03 
 
 		 1598 aa  291  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1474 aa  285  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  31.49 
 
 		 1193 aa  285  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.46 
 
 		 1557 aa  283  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.68 
 
 		 1856 aa  282  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  29.7 
 
 		 1247 aa  280  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  32.35 
 
 		 1364 aa  280  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  29.59 
 
 		 947 aa  279  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  31.23 
 
 		 1552 aa  278  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  37.91 
 
 		 1217 aa  275  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  29.13 
 
 		 1190 aa  273  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.28 
 
 		 1868 aa  273  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  30.55 
 
 		 1196 aa  273  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.82 
 
 		 1547 aa  271  7e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.47 
 
 		 919 aa  267  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.48 
 
 		 1583 aa  265  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.95 
 
 		 1609 aa  265  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.72 
 
 		 1617 aa  261  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.38 
 
 		 1623 aa  261  6e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  29.38 
 
 		 1443 aa  257  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  32.3 
 
 		 1901 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.35 
 
 		 1607 aa  256  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.53 
 
 		 1599 aa  256  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.19 
 
 		 1262 aa  253  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  33.14 
 
 		 1766 aa  251  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  31.62 
 
 		 1491 aa  251  8e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  29.03 
 
 		 1348 aa  241  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  33.49 
 
 		 1357 aa  241  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.49 
 
 		 1760 aa  241  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  35.11 
 
 		 781 aa  241  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  34.93 
 
 		 1344 aa  240  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.34 
 
 		 740 aa  240  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  28.84 
 
 		 1304 aa  238  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  36.19 
 
 		 2077 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  29.6 
 
 		 1661 aa  236  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  30.84 
 
 		 1714 aa  236  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  32.98 
 
 		 1807 aa  236  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.61 
 
 		 930 aa  234  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  35.09 
 
 		 1477 aa  231  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  26.09 
 
 		 1213 aa  231  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.86 
 
 		 924 aa  230  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  34.42 
 
 		 1914 aa  229  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  32.17 
 
 		 902 aa  228  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  32.31 
 
 		 902 aa  228  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.76 
 
 		 1823 aa  227  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  28.28 
 
 		 1242 aa  222  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  37.09 
 
 		 1908 aa  222  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  31.18 
 
 		 1280 aa  221  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  28.66 
 
 		 1858 aa  221  7.999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  33.42 
 
 		 1932 aa  220  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25.13 
 
 		 1188 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.4 
 
 		 1205 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  30.98 
 
 		 1416 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  25.91 
 
 		 728 aa  216  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  44.26 
 
 		 335 aa  211  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  33.22 
 
 		 565 aa  211  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.15 
 
 		 1208 aa  210  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.74 
 
 		 676 aa  205  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  33.88 
 
 		 344 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  33.51 
 
 		 344 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  35.63 
 
 		 1599 aa  201  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.72 
 
 		 1267 aa  196  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  30.85 
 
 		 1100 aa  195  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  26.22 
 
 		 1097 aa  195  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  27.22 
 
 		 1373 aa  194  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.53 
 
 		 692 aa  194  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  27.04 
 
 		 1209 aa  192  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.45 
 
 		 677 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  46.34 
 
 		 790 aa  192  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>