85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3059 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  100 
 
 
781 aa  1602    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  64.53 
 
 
335 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  35.45 
 
 
787 aa  432  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  55.34 
 
 
1164 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  54.37 
 
 
1908 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  53.83 
 
 
1190 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  52.05 
 
 
1163 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  50.93 
 
 
902 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  50.93 
 
 
902 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  54.5 
 
 
1367 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  52.33 
 
 
1161 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  52.33 
 
 
1161 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  50.27 
 
 
1914 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  50.96 
 
 
2077 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  48.9 
 
 
891 aa  358  2.9999999999999997e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  50.53 
 
 
1177 aa  353  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  48.52 
 
 
1932 aa  345  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  46.21 
 
 
1209 aa  334  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  48 
 
 
1176 aa  335  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  45.72 
 
 
1477 aa  334  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  35.11 
 
 
1214 aa  241  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  34.87 
 
 
1304 aa  233  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  34.58 
 
 
643 aa  227  7e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  35.93 
 
 
717 aa  220  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.446547  normal  0.266824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3878  sensor protein  36.36 
 
 
782 aa  214  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00432264  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1813  WD repeat-containing protein  37.18 
 
 
376 aa  211  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0550116  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4764  Serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  34.97 
 
 
746 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272035  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1855  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  34.41 
 
 
872 aa  203  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.311227  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  34.41 
 
 
872 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0382  putative Chase2 sensor protein  33 
 
 
783 aa  193  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  31.95 
 
 
1048 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  31.5 
 
 
865 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64169e-22 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1758  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  31.96 
 
 
583 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.49 
 
 
678 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2806  sensor protein  30.47 
 
 
633 aa  174  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682487  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4619  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  29.37 
 
 
841 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0311461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0638  diguanylate cyclase  28.28 
 
 
737 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  29.7 
 
 
744 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.47 
 
 
757 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
664 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 
922 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  29 
 
 
735 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2402  sensor protein  28.75 
 
 
619 aa  124  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532539  hitchhiker  0.0000375596 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5483  CHASE2 domain protein  29.2 
 
 
696 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0712134 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 
945 aa  118  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 
935 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5644  putative Chase2 sensor protein  24.3 
 
 
686 aa  111  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0408867 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4022  hypothetical protein  33.88 
 
 
854 aa  107  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864107  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1847  hypothetical protein  26.35 
 
 
870 aa  102  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.277811  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1353  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 
864 aa  93.6  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
702 aa  91.3  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  25.41 
 
 
466 aa  81.6  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  23.72 
 
 
547 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  25.57 
 
 
645 aa  73.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  22.88 
 
 
475 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  23.88 
 
 
500 aa  72.4  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  23.79 
 
 
456 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  23.79 
 
 
456 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  25 
 
 
457 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  23.98 
 
 
662 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  23.05 
 
 
520 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  24.52 
 
 
438 aa  65.1  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  21.45 
 
 
537 aa  64.7  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  23.85 
 
 
384 aa  64.7  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  23.02 
 
 
627 aa  62  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  25.1 
 
 
456 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  22.9 
 
 
877 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  22.91 
 
 
623 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  24.3 
 
 
446 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  25.37 
 
 
405 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  23.66 
 
 
456 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  22.96 
 
 
534 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  24.08 
 
 
456 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  23.67 
 
 
648 aa  58.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  22.98 
 
 
450 aa  57.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  21.98 
 
 
470 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  20.39 
 
 
638 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  20.79 
 
 
491 aa  54.7  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.86 
 
 
758 aa  52  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.49 
 
 
611 aa  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1897  metal-dependent phosphohydrolase  21.45 
 
 
671 aa  48.1  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  22.9 
 
 
511 aa  47.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0306  hypothetical protein  23.38 
 
 
526 aa  45.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1629  hypothetical protein  26.17 
 
 
534 aa  45.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.707644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
794 aa  44.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>