47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3808 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  74.78 
 
 		 456 aa  726    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  74.78 
 
 		 456 aa  726    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  948    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  45.74 
 
 		 627 aa  330  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  50.14 
 
 		 877 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  51.22 
 
 		 457 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  48.93 
 
 		 547 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  42.71 
 
 		 537 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  45.1 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  48.34 
 
 		 662 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  46.65 
 
 		 450 aa  307  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  47.79 
 
 		 446 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  45.4 
 
 		 475 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  47.89 
 
 		 648 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  47.62 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  47.49 
 
 		 456 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  46.67 
 
 		 470 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  47.49 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  43.68 
 
 		 466 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  43.35 
 
 		 638 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  41.95 
 
 		 520 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  40.79 
 
 		 623 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  38.82 
 
 		 534 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  40 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  36.47 
 
 		 491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  31.19 
 
 		 511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  28.61 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1446  hypothetical protein  40.74 
 
 		 117 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  24.13 
 
 		 902 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  24.13 
 
 		 902 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  25.98 
 
 		 1932 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  27.38 
 
 		 1908 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  25.41 
 
 		 1209 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  25.1 
 
 		 781 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4452  ATPase  26.98 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 1214 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  23.05 
 
 		 1367 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  23.55 
 
 		 2077 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  28.83 
 
 		 1161 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  22.91 
 
 		 1190 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  28.83 
 
 		 1161 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  22.73 
 
 		 1914 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  21.14 
 
 		 1163 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  22.4 
 
 		 1177 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  23.23 
 
 		 891 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  22.4 
 
 		 1176 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 		 335 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>