50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5745 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  791    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  59.58 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  57.75 
 
 		 547 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  53.67 
 
 		 450 aa  391  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  51.49 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  50.3 
 
 		 466 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  47.7 
 
 		 627 aa  353  4e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  47.32 
 
 		 662 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  48.66 
 
 		 648 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  48.53 
 
 		 877 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  46.39 
 
 		 638 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  44.99 
 
 		 537 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  47.45 
 
 		 446 aa  319  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  45.1 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  45.18 
 
 		 456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  45.18 
 
 		 456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  46.71 
 
 		 456 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  46.71 
 
 		 456 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  44.82 
 
 		 470 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  42.21 
 
 		 623 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  41.93 
 
 		 520 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  40 
 
 		 534 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  42.72 
 
 		 405 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  34.95 
 
 		 491 aa  226  7e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  36.97 
 
 		 438 aa  206  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  30.14 
 
 		 511 aa  149  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  26.69 
 
 		 500 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1446  hypothetical protein  40.17 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  27.6 
 
 		 902 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  27.6 
 
 		 902 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  25.5 
 
 		 1932 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.12 
 
 		 1163 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  26.39 
 
 		 1908 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  24.8 
 
 		 1209 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  22.84 
 
 		 1214 aa  67.4  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  22.4 
 
 		 1914 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  23.85 
 
 		 781 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 891 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  23.79 
 
 		 2077 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.6 
 
 		 1477 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  21.12 
 
 		 1367 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  22.79 
 
 		 1176 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.57 
 
 		 1161 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.57 
 
 		 1161 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1447  hypothetical protein  29.06 
 
 		 129 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  22.94 
 
 		 1190 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  22.07 
 
 		 1164 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4022  hypothetical protein  27.24 
 
 		 854 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  21.01 
 
 		 787 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.433927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>