53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4407 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  980    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  59.74 
 
 
466 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  42.03 
 
 
446 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  51.49 
 
 
384 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  48.84 
 
 
457 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  46.4 
 
 
547 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  38.91 
 
 
456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  38.91 
 
 
456 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  42.32 
 
 
627 aa  323  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  43.49 
 
 
648 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  45.13 
 
 
877 aa  313  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  41.64 
 
 
662 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  41.28 
 
 
450 aa  308  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  40.33 
 
 
537 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  39.06 
 
 
405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  43.54 
 
 
456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  43.54 
 
 
456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  45.4 
 
 
456 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  41.33 
 
 
638 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  33.06 
 
 
491 aa  280  4e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  40.12 
 
 
520 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  40.41 
 
 
470 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  39.45 
 
 
623 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  38.69 
 
 
534 aa  249  9e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  36.09 
 
 
438 aa  224  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  30.23 
 
 
511 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  28.15 
 
 
500 aa  136  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1446  hypothetical protein  40.78 
 
 
117 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  40.7 
 
 
464 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  44.83 
 
 
1196 aa  73.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.8 
 
 
1163 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  22.88 
 
 
781 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
1190 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  21.97 
 
 
1914 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  23.55 
 
 
1908 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  27.75 
 
 
1209 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  22.95 
 
 
891 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  23.4 
 
 
1932 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  23.43 
 
 
1367 aa  60.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  23.33 
 
 
902 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  23.33 
 
 
902 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.77 
 
 
1161 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  22.77 
 
 
1161 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  25.84 
 
 
1477 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  24.8 
 
 
2077 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  20.5 
 
 
1214 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  24.64 
 
 
1176 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.96 
 
 
1190 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  22.76 
 
 
1177 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1447  hypothetical protein  28.04 
 
 
129 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  24.54 
 
 
787 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4022  hypothetical protein  24.69 
 
 
854 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864107  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  21.45 
 
 
1164 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>