81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4814 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1107    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  48.11 
 
 
537 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  50.63 
 
 
627 aa  337  5e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  49.52 
 
 
877 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  47.46 
 
 
547 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  45.25 
 
 
648 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  42.2 
 
 
446 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  42.5 
 
 
520 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  39.37 
 
 
638 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  42.59 
 
 
456 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  42.59 
 
 
456 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  40 
 
 
384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  38.6 
 
 
457 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  40.57 
 
 
466 aa  257  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  38.82 
 
 
456 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  40.06 
 
 
662 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  38.69 
 
 
475 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  34.26 
 
 
623 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  42.52 
 
 
470 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  41.84 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  37.62 
 
 
450 aa  243  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  39.37 
 
 
456 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  39.37 
 
 
456 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  32.92 
 
 
491 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  55.49 
 
 
504 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  36.59 
 
 
438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0984  hypothetical protein  43.58 
 
 
413 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  31.6 
 
 
511 aa  157  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  26.44 
 
 
500 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2076  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like  32.67 
 
 
661 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.445606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1446  hypothetical protein  50.49 
 
 
117 aa  93.6  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3126  hypothetical protein  34.78 
 
 
383 aa  93.6  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000917483  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2661  hypothetical protein  30.53 
 
 
361 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  24.69 
 
 
1908 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  24.69 
 
 
902 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  24.69 
 
 
902 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5578  hypothetical protein  29.14 
 
 
502 aa  70.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  27.83 
 
 
496 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  22.22 
 
 
1914 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2348  hypothetical protein  28.73 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389344  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2010  hypothetical protein  28.05 
 
 
528 aa  67  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  30.41 
 
 
848 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  27.57 
 
 
1209 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  34.81 
 
 
1689 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  23 
 
 
1932 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 
1313 aa  63.9  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 
1450 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  30.06 
 
 
1104 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  23.87 
 
 
1214 aa  61.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  22.01 
 
 
1367 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 
1958 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  24.59 
 
 
891 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  24.55 
 
 
1190 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.32 
 
 
943 aa  59.3  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  22.96 
 
 
781 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  21.64 
 
 
2077 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.46 
 
 
1163 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 
1063 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2281  hypothetical protein  26.97 
 
 
440 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503347  normal  0.134184 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.42 
 
 
1161 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1319  hypothetical protein  28.18 
 
 
521 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.42 
 
 
1161 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  28.11 
 
 
689 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  33.88 
 
 
697 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.37 
 
 
1477 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2132  hypothetical protein  32.12 
 
 
699 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.565923  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  23.58 
 
 
1177 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
1101 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  26.98 
 
 
534 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.4 
 
 
1238 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  23.65 
 
 
1164 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1447  hypothetical protein  25 
 
 
129 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 
335 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  26.7 
 
 
1429 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  34.45 
 
 
467 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
1285 aa  47  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
1714 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5261  hypothetical protein  28.03 
 
 
690 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165104  hitchhiker  0.00234042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  30.84 
 
 
1914 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  20.33 
 
 
1176 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 
1596 aa  43.5  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>