48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0227 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  902    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  37.57 
 
 
877 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  39.88 
 
 
470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  40 
 
 
456 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  39.09 
 
 
627 aa  230  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  39.43 
 
 
446 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  36.64 
 
 
456 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  36.64 
 
 
456 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  36.2 
 
 
475 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  35.82 
 
 
638 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  35.78 
 
 
537 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  37.09 
 
 
466 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  33.19 
 
 
648 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  37.8 
 
 
520 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  34.26 
 
 
456 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  34.26 
 
 
456 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  37.28 
 
 
547 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  36.97 
 
 
384 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  36.55 
 
 
405 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  35.45 
 
 
457 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  36.59 
 
 
534 aa  199  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  33.52 
 
 
623 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  33.9 
 
 
662 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  34.72 
 
 
450 aa  190  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  29.15 
 
 
491 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1446  hypothetical protein  58.56 
 
 
117 aa  126  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  29.66 
 
 
511 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1447  hypothetical protein  51.69 
 
 
129 aa  116  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  22.63 
 
 
500 aa  87.8  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  27.48 
 
 
902 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  27.48 
 
 
902 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  24.52 
 
 
781 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  23.73 
 
 
891 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  22.6 
 
 
2077 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
335 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4022  hypothetical protein  23.64 
 
 
854 aa  53.9  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864107  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  22.3 
 
 
1209 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  27.5 
 
 
1214 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  22.41 
 
 
1177 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  20.32 
 
 
1367 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.6 
 
 
1163 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.98 
 
 
1161 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.98 
 
 
1161 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  24.03 
 
 
1190 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 
1932 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  23.71 
 
 
1914 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  23.67 
 
 
1908 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  20.86 
 
 
1176 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>