70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2972 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  100 
 
 
537 aa  1117    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  48.11 
 
 
534 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  55.62 
 
 
877 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  52.54 
 
 
627 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  52.4 
 
 
446 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  50 
 
 
456 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  50 
 
 
456 aa  356  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  50 
 
 
547 aa  343  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  45.33 
 
 
638 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  44.99 
 
 
384 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  45.13 
 
 
648 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  42.71 
 
 
456 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  44.07 
 
 
457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  41.94 
 
 
475 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  45.73 
 
 
470 aa  299  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  39.84 
 
 
456 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  39.84 
 
 
456 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  44.19 
 
 
520 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  42.65 
 
 
662 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  44.75 
 
 
405 aa  289  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  41.52 
 
 
450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  41.88 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  38.36 
 
 
623 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  35.53 
 
 
491 aa  253  6e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  35.78 
 
 
438 aa  218  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  54.19 
 
 
504 aa  192  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0984  hypothetical protein  44.78 
 
 
413 aa  183  9.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  33.75 
 
 
511 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  32.14 
 
 
500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2076  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like  37.99 
 
 
661 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.445606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5578  hypothetical protein  35.58 
 
 
502 aa  94  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2661  hypothetical protein  31.11 
 
 
361 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1446  hypothetical protein  40.78 
 
 
117 aa  80.9  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 
1908 aa  77  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2348  hypothetical protein  28.89 
 
 
254 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389344  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2010  hypothetical protein  28.57 
 
 
528 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1319  hypothetical protein  27.67 
 
 
521 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  25.65 
 
 
1914 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 
1932 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  24.79 
 
 
902 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  24.79 
 
 
902 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  24.3 
 
 
787 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3126  hypothetical protein  29.83 
 
 
383 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000917483  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  21.45 
 
 
781 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  24.6 
 
 
1367 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.88 
 
 
1163 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  23.05 
 
 
1214 aa  64.3  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  22.44 
 
 
891 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.64 
 
 
943 aa  60.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  23.05 
 
 
2077 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  26.15 
 
 
1176 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.38 
 
 
1161 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.38 
 
 
1161 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  26.22 
 
 
1177 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  22.96 
 
 
1477 aa  57.4  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  28.57 
 
 
496 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  21.01 
 
 
1238 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  26.76 
 
 
1164 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.14 
 
 
1190 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5261  hypothetical protein  28.21 
 
 
690 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165104  hitchhiker  0.00234042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  25.93 
 
 
1209 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 
335 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1447  hypothetical protein  30.39 
 
 
129 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  27.88 
 
 
1611 aa  48.5  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 
1063 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
1101 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2610  hypothetical protein  29.29 
 
 
120 aa  47  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.577355  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  32.17 
 
 
1104 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  28 
 
 
1689 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  30.7 
 
 
848 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>