257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1245 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  100 
 
 		 848 aa  1694    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  65.44 
 
 		 1450 aa  917    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  36.27 
 
 		 1104 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  25.96 
 
 		 975 aa  101  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  26.77 
 
 		 999 aa  99  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.59 
 
 		 1104 aa  99  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 1298 aa  98.2  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 		 1714 aa  88.2  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  28.15 
 
 		 978 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  29.95 
 
 		 782 aa  84.7  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 872 aa  84.7  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 1596 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  31.17 
 
 		 916 aa  82  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  22.89 
 
 		 816 aa  81.3  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 901 aa  81.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1238 aa  80.9  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  28.79 
 
 		 701 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  26.01 
 
 		 1056 aa  79.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  24.43 
 
 		 830 aa  78.6  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 736 aa  77.4  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 1285 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  30 
 
 		 1018 aa  74.7  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 1048 aa  74.7  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  31.44 
 
 		 630 aa  74.3  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  27 
 
 		 792 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  26.39 
 
 		 981 aa  73.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  23.91 
 
 		 991 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 812 aa  73.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 831 aa  72.4  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  32.39 
 
 		 1020 aa  72  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 982 aa  72  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  28.92 
 
 		 941 aa  71.2  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  31.68 
 
 		 969 aa  70.9  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  29.72 
 
 		 943 aa  70.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  27.19 
 
 		 1085 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 798 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  27.32 
 
 		 768 aa  69.7  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1101 aa  69.3  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  23.38 
 
 		 888 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  30.03 
 
 		 957 aa  68.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 910 aa  68.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  30.49 
 
 		 1914 aa  68.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 781 aa  68.2  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3350  GUN4-like  27.2 
 
 		 979 aa  68.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  27.22 
 
 		 1017 aa  68.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 952 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 1137 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  30.41 
 
 		 534 aa  67  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  27.52 
 
 		 928 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  30.49 
 
 		 630 aa  66.6  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 490 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 945 aa  65.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  29.19 
 
 		 828 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  27.51 
 
 		 618 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  28.26 
 
 		 1076 aa  65.1  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 1034 aa  65.1  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  24.53 
 
 		 950 aa  65.1  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  25.43 
 
 		 1042 aa  64.7  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  30.51 
 
 		 965 aa  64.3  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  27.57 
 
 		 922 aa  64.3  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  27.8 
 
 		 799 aa  63.9  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 418 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.93 
 
 		 609 aa  64.3  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  27.89 
 
 		 953 aa  63.9  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.25 
 
 		 991 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  30.6 
 
 		 907 aa  63.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 729 aa  64.3  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 1313 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  25.51 
 
 		 1050 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  26.93 
 
 		 1079 aa  63.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  27.65 
 
 		 1036 aa  62.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 948 aa  62  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  27.99 
 
 		 1005 aa  62.4  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 1043 aa  62  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  25.39 
 
 		 1049 aa  62  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  29.03 
 
 		 1014 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  26.13 
 
 		 827 aa  60.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 1060 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  26.75 
 
 		 1027 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  25 
 
 		 996 aa  60.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  29.5 
 
 		 1044 aa  60.1  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 810 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  32.05 
 
 		 755 aa  59.7  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  29.22 
 
 		 951 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  30.65 
 
 		 1022 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 922 aa  60.1  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  27.99 
 
 		 824 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  26.49 
 
 		 678 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  25.08 
 
 		 797 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  25.45 
 
 		 1064 aa  58.9  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  25.33 
 
 		 961 aa  58.9  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1073 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 966 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  29.01 
 
 		 1141 aa  58.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  28.23 
 
 		 760 aa  58.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  30.03 
 
 		 886 aa  58.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 980 aa  58.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.56 
 
 		 1266 aa  58.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 1085 aa  58.2  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>