87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3350 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3350  GUN4-like  100 
 
 		 979 aa  2014    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0047  hypothetical protein  48.08 
 
 		 489 aa  405  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1020 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  26.59 
 
 		 1429 aa  150  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4973  GUN4-like  50.38 
 
 		 338 aa  121  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0178  GUN4-like  48.18 
 
 		 559 aa  114  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000497221  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1722  serine/threonine protein kinase  42.66 
 
 		 505 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0710398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  25.86 
 
 		 1611 aa  103  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1723  serine/threonine protein kinase  42.55 
 
 		 494 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1238 aa  100  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  41.22 
 
 		 887 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4987  GUN4 domain protein  40.74 
 
 		 336 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.691295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1053  GUN4 domain protein  39.86 
 
 		 670 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0234472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1526 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2617  GUN4-like  45.38 
 
 		 600 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000986346  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2618  GUN4-like  41.98 
 
 		 623 aa  95.5  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.0000189308  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  41.67 
 
 		 888 aa  95.1  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  40.44 
 
 		 684 aa  91.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0174  GUN4-like  41.22 
 
 		 552 aa  90.9  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  31.13 
 
 		 818 aa  90.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5109  GUN4 domain protein  37.66 
 
 		 441 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2988  GUN4 domain protein  31.13 
 
 		 240 aa  86.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0701  GUN4 domain protein  39.04 
 
 		 165 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  21.68 
 
 		 1063 aa  85.5  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0730  GUN4 domain protein  38.36 
 
 		 165 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.384858  normal  0.0865709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1622  GUN4 domain protein  37.59 
 
 		 170 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4843  GUN4 domain protein  31.44 
 
 		 191 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977893 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5443  GUN4 domain protein  29.35 
 
 		 526 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180274 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  21.46 
 
 		 1313 aa  79.3  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 1714 aa  75.5  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4617  GUN4 domain protein  34.78 
 
 		 393 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2743  GUN4 domain protein  34.75 
 
 		 203 aa  72  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  29.49 
 
 		 1914 aa  71.6  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1623  GUN4-like  44.3 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.484626  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1918  GUN4-like  38.1 
 
 		 135 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.505634  normal  0.0848104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3945  GUN4-like  33.82 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0311749 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  27.2 
 
 		 848 aa  67.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2959  GUN4 domain protein  30.25 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3159  GUN4 domain protein  30.25 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  21.28 
 
 		 1101 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2272  GUN4 domain protein  31.06 
 
 		 378 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2323  GUN4 domain protein  31.06 
 
 		 378 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.81 
 
 		 490 aa  63.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4115  GUN4 domain protein  31.4 
 
 		 194 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.657757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4076  GUN4 domain protein  31.4 
 
 		 194 aa  62  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  23.54 
 
 		 1285 aa  61.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1596 aa  60.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1805 aa  58.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4830  GUN4-like  37.93 
 
 		 279 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0208918 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5320  GUN4 domain protein  32.14 
 
 		 150 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.505664  normal  0.459324 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1883  hypothetical protein  31.39 
 
 		 239 aa  57  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 1450 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  25 
 
 		 534 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0137  hypothetical protein  37.5 
 
 		 238 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.649821  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0002  ankyrin  28.39 
 
 		 578 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  22.79 
 
 		 835 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07691  hypothetical protein  37.5 
 
 		 238 aa  53.5  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.627035  normal  0.0617778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.91 
 
 		 3537 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15980  predicted protein  30.93 
 
 		 119 aa  53.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  22.65 
 
 		 1298 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.37 
 
 		 3535 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.37 
 
 		 3419 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4854  GUN4 domain protein  28.14 
 
 		 202 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2558  GUN4 domain protein  28.57 
 
 		 243 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3548  GUN4 domain protein  28.57 
 
 		 243 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1214  GUN4 domain-containing protein  27.61 
 
 		 237 aa  51.6  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  25.29 
 
 		 467 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2446  GUN4 domain protein  27.52 
 
 		 250 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.786071  hitchhiker  0.0000000955131 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0033  heterocyst differentiation protein HetF  23.88 
 
 		 823 aa  50.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.25 
 
 		 3299 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.82 
 
 		 3298 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3036  GUN4-like  36.25 
 
 		 240 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082563 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09361  hypothetical protein  40 
 
 		 239 aa  48.9  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09351  hypothetical protein  38.67 
 
 		 239 aa  48.5  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2281  hypothetical protein  25.74 
 
 		 440 aa  48.9  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503347  normal  0.134184 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1209 aa  48.5  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07221  hypothetical protein  33.75 
 
 		 259 aa  48.5  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.262793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  24.63 
 
 		 496 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 		 868 aa  47  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.18 
 
 		 1650 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  22.02 
 
 		 809 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4106  GUN4-like protein  36.36 
 
 		 215 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10071  hypothetical protein  37.33 
 
 		 244 aa  46.2  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.922133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  26.28 
 
 		 2159 aa  45.8  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0876  hypothetical protein  37.33 
 
 		 239 aa  45.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.837911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4714  GUN4 domain protein  35.44 
 
 		 256 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.322945 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 796 aa  44.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>