More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0791 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  59.27 
 
 		 1313 aa  1226    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  71.12 
 
 		 1101 aa  1526    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1063 aa  2182    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1238 aa  259  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  42.31 
 
 		 782 aa  200  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  41.94 
 
 		 1060 aa  178  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  39.32 
 
 		 828 aa  167  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  38 
 
 		 985 aa  165  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.68 
 
 		 991 aa  155  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 412 aa  154  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  35.75 
 
 		 1266 aa  152  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 408 aa  138  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  35.02 
 
 		 343 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  33.48 
 
 		 1914 aa  137  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  21.91 
 
 		 1611 aa  134  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 1714 aa  133  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  33.77 
 
 		 957 aa  129  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  31.17 
 
 		 689 aa  128  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  34.87 
 
 		 340 aa  127  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 923 aa  126  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 1261 aa  124  9e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  33.21 
 
 		 438 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  32.84 
 
 		 941 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 1526 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  37.39 
 
 		 454 aa  115  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  27.36 
 
 		 725 aa  116  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  33.77 
 
 		 2145 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 1596 aa  111  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1550 aa  110  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  28.52 
 
 		 1147 aa  110  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 		 949 aa  110  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  25.28 
 
 		 825 aa  108  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.31 
 
 		 852 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.21 
 
 		 609 aa  106  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 760 aa  105  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  32.23 
 
 		 1009 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  23.82 
 
 		 999 aa  105  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  27.92 
 
 		 490 aa  103  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.45 
 
 		 809 aa  101  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1450 aa  100  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 1025 aa  99.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  27.64 
 
 		 755 aa  98.6  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1298 aa  98.2  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 850 aa  97.8  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  28.04 
 
 		 1404 aa  97.1  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.55 
 
 		 1186 aa  96.3  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.88 
 
 		 943 aa  95.1  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 751 aa  94.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  28.72 
 
 		 1021 aa  94.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.21 
 
 		 1279 aa  92.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1298 aa  91.7  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.11 
 
 		 1104 aa  89.7  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  27.18 
 
 		 971 aa  90.1  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  25.34 
 
 		 834 aa  89.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.13 
 
 		 1162 aa  89  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  28.71 
 
 		 991 aa  89  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  25.83 
 
 		 775 aa  88.6  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  26.88 
 
 		 981 aa  88.6  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 1958 aa  88.2  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 1162 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 1071 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.2 
 
 		 1295 aa  87  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  25.84 
 
 		 650 aa  87  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2620  Tetratricopeptide TPR_4  31.03 
 
 		 303 aa  86.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.866097  normal  0.0216756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3350  GUN4-like  21.68 
 
 		 979 aa  85.9  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  28.84 
 
 		 1108 aa  85.9  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  26.42 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 809 aa  85.1  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  29.41 
 
 		 945 aa  85.1  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.6 
 
 		 1468 aa  84  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 659 aa  84  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  29.65 
 
 		 1013 aa  83.2  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 		 965 aa  82.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  27.12 
 
 		 740 aa  82.4  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 1048 aa  82  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  30.9 
 
 		 1039 aa  82  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  31.11 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  28.25 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 545 aa  81.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1212 aa  80.9  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  28.99 
 
 		 1020 aa  81.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  25.67 
 
 		 357 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1508  hypothetical protein  59.38 
 
 		 64 aa  80.5  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.213488  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 1319 aa  80.1  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2835  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 287 aa  80.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  25.09 
 
 		 496 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.9 
 
 		 560 aa  80.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.18 
 
 		 787 aa  80.1  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0621  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 368 aa  80.1  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 481 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  25.77 
 
 		 671 aa  79.7  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  27.94 
 
 		 816 aa  79.3  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 		 742 aa  78.2  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.48 
 
 		 771 aa  77.8  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.74 
 
 		 1195 aa  77.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  28.14 
 
 		 836 aa  77.8  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  22.11 
 
 		 956 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  33.14 
 
 		 732 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 		 934 aa  77  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.44 
 
 		 1424 aa  76.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>