More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1562 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  99.74 
 
 
1162 aa  2355    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1162 aa  2364    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 
923 aa  261  7e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 
1060 aa  255  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
1025 aa  243  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.38 
 
 
1328 aa  226  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.1 
 
 
2741 aa  208  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
991 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.48 
 
 
2741 aa  206  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.25 
 
 
782 aa  204  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 
1215 aa  201  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  26.3 
 
 
919 aa  199  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  24.51 
 
 
1009 aa  197  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  27.46 
 
 
985 aa  196  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.87 
 
 
828 aa  194  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  23.1 
 
 
1266 aa  192  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
854 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  23.52 
 
 
916 aa  169  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 
412 aa  160  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.23 
 
 
2145 aa  160  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  24.51 
 
 
809 aa  159  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 
949 aa  143  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.15 
 
 
957 aa  142  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.64 
 
 
968 aa  139  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 
1313 aa  137  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  22.67 
 
 
903 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
937 aa  127  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
851 aa  125  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
729 aa  122  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  22.91 
 
 
1475 aa  120  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  24.95 
 
 
989 aa  118  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 
928 aa  118  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  30.35 
 
 
1550 aa  118  7.999999999999999e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  36.13 
 
 
1246 aa  115  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  27.76 
 
 
725 aa  115  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.06 
 
 
1238 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  19.93 
 
 
1914 aa  114  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 
1711 aa  114  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 
1450 aa  111  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  27.58 
 
 
717 aa  111  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
1409 aa  110  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  24.62 
 
 
884 aa  109  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  34.35 
 
 
1054 aa  109  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  29.75 
 
 
532 aa  108  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  23.65 
 
 
941 aa  108  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.35 
 
 
854 aa  108  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  27 
 
 
905 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  27 
 
 
905 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.22 
 
 
1135 aa  105  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  26.96 
 
 
893 aa  105  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 
1365 aa  104  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  25.32 
 
 
1219 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.29 
 
 
1186 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  27.73 
 
 
853 aa  102  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  31.28 
 
 
689 aa  102  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
868 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  34.33 
 
 
840 aa  99.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 
1036 aa  99.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.34 
 
 
609 aa  99  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  27.15 
 
 
950 aa  98.6  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  27.15 
 
 
950 aa  98.6  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  20.98 
 
 
1261 aa  98.6  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 
1101 aa  97.8  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  25.53 
 
 
1024 aa  97.4  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  19.27 
 
 
1714 aa  97.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 
851 aa  96.3  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 
408 aa  96.3  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 
883 aa  95.5  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  32.12 
 
 
960 aa  94  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  31.9 
 
 
845 aa  93.2  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  33.14 
 
 
1051 aa  93.2  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 
822 aa  92.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 
846 aa  92  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.48 
 
 
868 aa  91.3  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  30.41 
 
 
1025 aa  90.9  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3448  hypothetical protein  21.59 
 
 
847 aa  90.5  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.498192  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  34.86 
 
 
992 aa  89.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 
438 aa  89.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  25.21 
 
 
944 aa  89  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
343 aa  88.6  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  31.45 
 
 
891 aa  88.2  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  24.5 
 
 
1404 aa  87.8  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  23.07 
 
 
1779 aa  87.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  28.4 
 
 
825 aa  87  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  31.14 
 
 
192 aa  87  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
760 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 
1247 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
1063 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  33.73 
 
 
1039 aa  86.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  27 
 
 
755 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  25.06 
 
 
740 aa  85.5  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  26.84 
 
 
493 aa  85.5  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  30.69 
 
 
1228 aa  85.1  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.65 
 
 
904 aa  84.7  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  26.35 
 
 
357 aa  83.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.72 
 
 
767 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  24.84 
 
 
340 aa  83.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  22.63 
 
 
1048 aa  82.8  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  29.61 
 
 
1106 aa  81.6  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  22.51 
 
 
909 aa  82  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>