93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2097 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  100 
 
 
1024 aa  2049    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  31.94 
 
 
989 aa  163  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.23 
 
 
1135 aa  159  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
1036 aa  150  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  33.5 
 
 
937 aa  148  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  25.87 
 
 
1025 aa  144  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  31.26 
 
 
1028 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  26.35 
 
 
1051 aa  137  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  27.31 
 
 
1039 aa  132  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
923 aa  131  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
1025 aa  127  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  31.01 
 
 
934 aa  114  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  29.7 
 
 
877 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.3 
 
 
1162 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 
1162 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 
916 aa  97.8  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  27.81 
 
 
1009 aa  96.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
1215 aa  95.1  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  33.8 
 
 
903 aa  91.7  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 
854 aa  89.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  24.37 
 
 
884 aa  89.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  31.19 
 
 
809 aa  89.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
729 aa  89  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 
1054 aa  84.3  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.69 
 
 
968 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  26.23 
 
 
919 aa  83.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.24 
 
 
2741 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
2741 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 
846 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  27.8 
 
 
840 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1492  hypothetical protein  28.57 
 
 
1259 aa  79.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  24.92 
 
 
1328 aa  77.8  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
883 aa  75.1  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  35.33 
 
 
893 aa  75.1  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
905 aa  74.7  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
905 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  27.27 
 
 
845 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
937 aa  73.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.33 
 
 
957 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  24.48 
 
 
717 aa  72.4  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  28.99 
 
 
891 aa  72.4  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 
868 aa  71.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 
949 aa  70.5  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  24.76 
 
 
960 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
1365 aa  70.1  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
868 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 
1409 aa  68.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  30.05 
 
 
853 aa  67.8  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  29.38 
 
 
950 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  29.38 
 
 
950 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  27.5 
 
 
192 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.3 
 
 
854 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
1060 aa  65.1  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  29.63 
 
 
1475 aa  64.7  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
851 aa  64.7  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  33.03 
 
 
828 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.88 
 
 
991 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
851 aa  60.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  31.21 
 
 
532 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
1711 aa  58.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  28.3 
 
 
1246 aa  58.2  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  27.49 
 
 
944 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  32 
 
 
1507 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.53 
 
 
904 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  31.41 
 
 
1142 aa  55.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  21.44 
 
 
909 aa  55.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.3 
 
 
1186 aa  55.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  30.77 
 
 
121 aa  55.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  22.25 
 
 
796 aa  54.7  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  24.56 
 
 
1805 aa  54.3  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 
928 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.23 
 
 
3299 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1164  hypothetical protein  28.4 
 
 
643 aa  52.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  29.86 
 
 
1051 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  26.17 
 
 
918 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.65 
 
 
1424 aa  51.6  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  26.52 
 
 
447 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.37 
 
 
3537 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  33.14 
 
 
418 aa  50.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.64 
 
 
1650 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 
1055 aa  48.9  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  22.41 
 
 
1772 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 
1276 aa  49.3  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.32 
 
 
3298 aa  48.5  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.46 
 
 
3535 aa  48.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.46 
 
 
3419 aa  48.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
822 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  29.9 
 
 
959 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  25.85 
 
 
1878 aa  46.2  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  24.41 
 
 
992 aa  45.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
994 aa  44.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 
751 aa  44.7  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  25.95 
 
 
2159 aa  44.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.932976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>