110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3265 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  100 
 
 
845 aa  1706    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  85.19 
 
 
840 aa  1398    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.48 
 
 
854 aa  492  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 
868 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  36.76 
 
 
950 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  35.85 
 
 
950 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  36.54 
 
 
960 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 
885 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  35.89 
 
 
891 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 
851 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  33.79 
 
 
853 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  35.99 
 
 
905 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  35.99 
 
 
905 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
822 aa  369  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  32.37 
 
 
944 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.46 
 
 
904 aa  366  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
883 aa  321  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  30.62 
 
 
796 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  30.29 
 
 
725 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  29.42 
 
 
698 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.67 
 
 
1772 aa  168  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.82 
 
 
1650 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  28.66 
 
 
553 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.79 
 
 
3299 aa  155  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.42 
 
 
3298 aa  154  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  27.82 
 
 
809 aa  154  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.42 
 
 
3535 aa  153  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.42 
 
 
3419 aa  153  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.89 
 
 
3537 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  31.9 
 
 
447 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.97 
 
 
2637 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  28.62 
 
 
957 aa  145  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  30.26 
 
 
1009 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  31.7 
 
 
418 aa  137  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 
1060 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  31.07 
 
 
828 aa  117  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.25 
 
 
991 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
949 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.06 
 
 
2741 aa  99.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  31.09 
 
 
919 aa  98.6  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  30.66 
 
 
1328 aa  97.8  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  27.1 
 
 
532 aa  95.5  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.7 
 
 
2741 aa  95.1  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 
1162 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.9 
 
 
1162 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 
851 aa  89.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
916 aa  87.4  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  26.43 
 
 
893 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
1215 aa  80.9  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.02 
 
 
968 aa  80.9  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  28.67 
 
 
884 aa  79.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 
729 aa  79  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  26.91 
 
 
717 aa  77  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  25.99 
 
 
827 aa  75.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  30.85 
 
 
192 aa  75.1  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  31.07 
 
 
565 aa  74.3  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
937 aa  72  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  24.53 
 
 
903 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 
854 aa  70.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 
846 aa  68.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  26.01 
 
 
1171 aa  68.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
1409 aa  65.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
1365 aa  65.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  27.94 
 
 
1475 aa  65.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  27.27 
 
 
1024 aa  65.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  28.79 
 
 
909 aa  65.1  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 
1054 aa  64.7  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  25.91 
 
 
874 aa  63.9  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
994 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  31.62 
 
 
121 aa  63.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 
868 aa  62.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
1055 aa  62  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 
1186 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  28.02 
 
 
989 aa  60.8  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  28.67 
 
 
897 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 
1025 aa  60.1  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 
928 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  23.32 
 
 
1007 aa  58.9  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
923 aa  58.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  29.01 
 
 
937 aa  57.4  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1492  hypothetical protein  26.53 
 
 
1259 aa  57  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 
1192 aa  56.6  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  25.22 
 
 
905 aa  55.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 
1711 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  22.63 
 
 
1051 aa  54.7  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  32.43 
 
 
1246 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 
1779 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
1036 aa  52.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  25.12 
 
 
1476 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  24.54 
 
 
1238 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0254  hypothetical protein  85 
 
 
46 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0233368 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  23.48 
 
 
1058 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  23.81 
 
 
1219 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  28.57 
 
 
1077 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  26.71 
 
 
934 aa  48.5  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 
1276 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 
1507 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  26.97 
 
 
1039 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  29.69 
 
 
1247 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1925  hypothetical protein  27.59 
 
 
783 aa  46.6  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>