221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1756 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  46.75 
 
 
851 aa  733    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  49.64 
 
 
868 aa  778    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
854 aa  1707    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  45.75 
 
 
853 aa  702    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  45.48 
 
 
950 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  45.38 
 
 
950 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  43.17 
 
 
885 aa  622  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  42.01 
 
 
944 aa  612  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  41.86 
 
 
891 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  40.02 
 
 
960 aa  574  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  39.09 
 
 
905 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  39.31 
 
 
905 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.22 
 
 
904 aa  552  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  38.48 
 
 
845 aa  481  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  39.52 
 
 
840 aa  480  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
822 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 
883 aa  369  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 
796 aa  300  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  33.53 
 
 
725 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.29 
 
 
3537 aa  207  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.04 
 
 
3419 aa  197  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.51 
 
 
3298 aa  197  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.04 
 
 
3535 aa  197  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.04 
 
 
3299 aa  197  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  30 
 
 
698 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  33.64 
 
 
447 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.88 
 
 
1772 aa  192  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  38.41 
 
 
553 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  33.88 
 
 
1009 aa  189  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.57 
 
 
1650 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25.14 
 
 
957 aa  184  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  33.9 
 
 
809 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  35.46 
 
 
418 aa  171  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.69 
 
 
2637 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 
949 aa  145  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
1060 aa  125  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  31.32 
 
 
828 aa  115  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  32.28 
 
 
1328 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  31.71 
 
 
919 aa  110  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
1162 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.35 
 
 
1162 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 
916 aa  108  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.84 
 
 
2741 aa  104  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.45 
 
 
2741 aa  104  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  29.97 
 
 
532 aa  101  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
729 aa  100  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.28 
 
 
968 aa  97.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  28.57 
 
 
717 aa  96.3  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  35.15 
 
 
192 aa  95.9  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  28.49 
 
 
893 aa  95.5  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
1215 aa  95.9  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  23.68 
 
 
782 aa  90.9  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  28.26 
 
 
985 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  25.93 
 
 
1475 aa  86.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  28.72 
 
 
884 aa  85.1  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
854 aa  84  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 
1036 aa  80.1  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.18 
 
 
991 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
937 aa  80.1  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
851 aa  79.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  32.41 
 
 
2145 aa  78.2  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  30.27 
 
 
565 aa  77.8  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  29.22 
 
 
1266 aa  75.5  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.69 
 
 
1238 aa  75.1  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
1054 aa  74.3  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  25.27 
 
 
1039 aa  73.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
1101 aa  71.6  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
1025 aa  71.2  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  29.34 
 
 
1550 aa  70.9  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 
928 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 
1313 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 
1063 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  26.16 
 
 
903 aa  68.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  35.14 
 
 
121 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
1261 aa  67  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  26.37 
 
 
1051 aa  67  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  23.93 
 
 
725 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.3 
 
 
1186 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
1365 aa  65.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 
846 aa  65.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 
444 aa  65.1  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  26.18 
 
 
1914 aa  64.7  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  23.91 
 
 
1051 aa  64.7  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  26.75 
 
 
689 aa  64.3  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  23 
 
 
1247 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  26.67 
 
 
1025 aa  64.3  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 
659 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  29.76 
 
 
1246 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  27.38 
 
 
1476 aa  62.4  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 
1409 aa  62  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 
343 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
923 aa  61.2  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  23.11 
 
 
799 aa  60.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
1276 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.64 
 
 
1007 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  32.67 
 
 
989 aa  60.1  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  25.63 
 
 
1507 aa  58.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  28.3 
 
 
1024 aa  58.5  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  34.65 
 
 
937 aa  58.2  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  28.05 
 
 
340 aa  57.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>