110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2461 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  98.78 
 
 
905 aa  1794    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
905 aa  1816    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  42.3 
 
 
891 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.52 
 
 
854 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  38.5 
 
 
868 aa  556  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  39.62 
 
 
950 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  39.55 
 
 
950 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 
885 aa  509  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  35.49 
 
 
851 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  36.68 
 
 
853 aa  501  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  36.1 
 
 
944 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  33.76 
 
 
960 aa  473  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.27 
 
 
904 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  35.95 
 
 
845 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  35.38 
 
 
840 aa  392  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 
822 aa  362  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
883 aa  338  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 
796 aa  266  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.76 
 
 
1772 aa  195  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  31.04 
 
 
553 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.7 
 
 
3535 aa  188  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.7 
 
 
3298 aa  188  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.7 
 
 
3419 aa  187  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.8 
 
 
3537 aa  186  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  34.28 
 
 
1009 aa  183  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.87 
 
 
3299 aa  183  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  30.58 
 
 
698 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.51 
 
 
1650 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  37.46 
 
 
447 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.1 
 
 
2637 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  31.17 
 
 
725 aa  164  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  29.5 
 
 
957 aa  158  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  32.06 
 
 
828 aa  153  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  31.99 
 
 
809 aa  149  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  28.57 
 
 
418 aa  149  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 
949 aa  146  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 
1060 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.01 
 
 
991 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  30.24 
 
 
717 aa  117  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  27 
 
 
1162 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27 
 
 
1162 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  29.71 
 
 
1328 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  29.41 
 
 
919 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  33.51 
 
 
192 aa  94.7  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.41 
 
 
2741 aa  93.6  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.58 
 
 
1215 aa  93.2  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.52 
 
 
2741 aa  92.4  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 
916 aa  91.7  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 
893 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  30.1 
 
 
532 aa  84.7  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 
729 aa  84.7  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  26.12 
 
 
884 aa  80.9  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 
854 aa  78.6  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.43 
 
 
968 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  30.04 
 
 
565 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
1054 aa  69.3  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
1036 aa  69.7  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  28.15 
 
 
903 aa  67.8  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 
937 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  39.39 
 
 
1475 aa  67.4  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  34.55 
 
 
121 aa  66.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  24.75 
 
 
909 aa  67  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 
1409 aa  66.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.74 
 
 
1186 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 
1025 aa  64.7  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  35.77 
 
 
827 aa  64.7  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  31.7 
 
 
1024 aa  64.7  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  27.73 
 
 
1039 aa  64.3  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  30.95 
 
 
1051 aa  64.3  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 
851 aa  62  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  37 
 
 
923 aa  61.6  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
1365 aa  61.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  29.8 
 
 
989 aa  60.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.63 
 
 
1135 aa  60.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
1055 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 
846 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  28.34 
 
 
1025 aa  58.5  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
1711 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  28.24 
 
 
992 aa  56.6  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6950  hypothetical protein  36.43 
 
 
909 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.568828  normal  0.658727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  27.87 
 
 
934 aa  54.7  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
994 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  26.11 
 
 
1051 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  28.48 
 
 
1171 aa  53.5  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  32.24 
 
 
937 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.67 
 
 
1007 aa  52.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  29.03 
 
 
1246 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  26.49 
 
 
877 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  23.99 
 
 
918 aa  51.6  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  34.51 
 
 
1142 aa  51.2  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
928 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1492  hypothetical protein  24.38 
 
 
1259 aa  50.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  30.99 
 
 
1241 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  33.59 
 
 
1228 aa  49.3  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  42.67 
 
 
1507 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  29.05 
 
 
897 aa  49.7  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  31.51 
 
 
1441 aa  48.5  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1247 aa  48.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  24.52 
 
 
1077 aa  47.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 
402 aa  47.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>