119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0380 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  41.89 
 
 
950 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  100 
 
 
960 aa  1951    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  41.78 
 
 
950 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  40.6 
 
 
885 aa  581  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.45 
 
 
854 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  39.27 
 
 
868 aa  566  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 
851 aa  539  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  37.51 
 
 
891 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  37.16 
 
 
944 aa  525  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.15 
 
 
904 aa  522  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  36.78 
 
 
853 aa  501  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 
905 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
905 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  37.59 
 
 
840 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  36.43 
 
 
845 aa  437  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 
822 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
883 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  32.83 
 
 
796 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  28.45 
 
 
698 aa  178  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.82 
 
 
1650 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  32.97 
 
 
809 aa  158  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  26.39 
 
 
725 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  30.06 
 
 
553 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.56 
 
 
1772 aa  147  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  28.89 
 
 
447 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  28.14 
 
 
418 aa  146  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  29.38 
 
 
1009 aa  145  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.64 
 
 
3298 aa  143  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.71 
 
 
3535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.63 
 
 
3299 aa  143  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.71 
 
 
3419 aa  142  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  28.07 
 
 
957 aa  142  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.24 
 
 
3537 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.63 
 
 
2637 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 
1060 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  30.32 
 
 
828 aa  117  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
949 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  30 
 
 
1328 aa  104  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.87 
 
 
991 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  27.51 
 
 
919 aa  95.1  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.12 
 
 
1162 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
1215 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
1162 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.05 
 
 
2741 aa  88.2  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.75 
 
 
2741 aa  87.8  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  28.2 
 
 
532 aa  87.8  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 
916 aa  87  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  37.13 
 
 
192 aa  85.1  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
851 aa  84  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  28.62 
 
 
884 aa  82  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  26.52 
 
 
717 aa  80.1  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
729 aa  79  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  27.45 
 
 
893 aa  76.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.69 
 
 
968 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  42.59 
 
 
121 aa  74.7  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  21.47 
 
 
989 aa  72  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 
846 aa  71.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 
854 aa  70.1  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 
1025 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  28.57 
 
 
909 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  30.13 
 
 
827 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 
928 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  25.23 
 
 
1051 aa  65.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
1054 aa  62.4  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  26.36 
 
 
565 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  23.53 
 
 
1025 aa  62  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  24.29 
 
 
1024 aa  62  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  25.08 
 
 
903 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
1409 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
1036 aa  59.7  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  22.14 
 
 
934 aa  59.7  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 
1186 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  24.89 
 
 
1039 aa  58.9  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 
994 aa  58.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 
937 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 
923 aa  57  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  26.43 
 
 
937 aa  55.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.42 
 
 
2145 aa  55.8  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
1711 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.49 
 
 
782 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  31.07 
 
 
1475 aa  55.5  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  27.44 
 
 
874 aa  55.1  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.75 
 
 
1007 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  33.06 
 
 
811 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
1365 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  34.62 
 
 
1228 aa  53.5  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  27.42 
 
 
1051 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6950  hypothetical protein  34.11 
 
 
909 aa  52.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.568828  normal  0.658727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 
1135 aa  51.6  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
1055 aa  51.6  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  31.67 
 
 
1246 aa  51.2  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  26.22 
 
 
1219 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 
1247 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  34.26 
 
 
1476 aa  49.3  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 
1779 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  23.14 
 
 
918 aa  48.9  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  24.82 
 
 
1238 aa  48.5  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1019  hypothetical protein  28.49 
 
 
659 aa  48.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.172565  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.07 
 
 
1279 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  23.86 
 
 
1096 aa  48.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>