69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5481 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  100 
 
 
698 aa  1409    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  35.52 
 
 
725 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
796 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  31.29 
 
 
891 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
868 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  31.07 
 
 
950 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  31.07 
 
 
950 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
854 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  29.64 
 
 
944 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
885 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
851 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
883 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  28.71 
 
 
853 aa  184  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  29.97 
 
 
845 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  28.45 
 
 
840 aa  183  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  28.45 
 
 
960 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
905 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
905 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.75 
 
 
904 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 
822 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.36 
 
 
3537 aa  130  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.75 
 
 
3299 aa  128  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.03 
 
 
3298 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.03 
 
 
3419 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.03 
 
 
3535 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  33.21 
 
 
553 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  29.71 
 
 
418 aa  120  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.33 
 
 
1650 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.73 
 
 
957 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  30.64 
 
 
447 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  29.32 
 
 
828 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.2 
 
 
1772 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.36 
 
 
2637 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
1060 aa  91.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  29.35 
 
 
809 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.71 
 
 
991 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  26.6 
 
 
1009 aa  84  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  24.83 
 
 
532 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 
949 aa  83.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
729 aa  72.4  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25.83 
 
 
1328 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.6 
 
 
968 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 
916 aa  70.1  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  25.83 
 
 
919 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 
1215 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  21.68 
 
 
1409 aa  68.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
1054 aa  67.8  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
937 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
1025 aa  61.2  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 
854 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  24.89 
 
 
909 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  26.01 
 
 
893 aa  58.9  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  22.99 
 
 
1051 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 
1365 aa  57.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 
1162 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.98 
 
 
1162 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  26.82 
 
 
884 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 
1055 aa  55.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  26.29 
 
 
717 aa  55.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 
1276 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 
851 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  24.77 
 
 
874 aa  47  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  24.06 
 
 
565 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  25.76 
 
 
827 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  27.11 
 
 
1475 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  26.44 
 
 
989 aa  46.6  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
868 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  24.06 
 
 
903 aa  45.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 
846 aa  43.9  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>