121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2565 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
851 aa  1725    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  50.81 
 
 
868 aa  781    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  82.3 
 
 
853 aa  1409    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.75 
 
 
854 aa  726    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  43.44 
 
 
885 aa  625  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  41.28 
 
 
950 aa  619  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  41.16 
 
 
950 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  38.74 
 
 
944 aa  566  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  37.61 
 
 
960 aa  535  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  38.05 
 
 
891 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.71 
 
 
904 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  35.49 
 
 
905 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 
905 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  35.28 
 
 
840 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  34.16 
 
 
845 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
822 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 
883 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  35.28 
 
 
796 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  31.3 
 
 
725 aa  217  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  29.44 
 
 
698 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.68 
 
 
3299 aa  180  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.99 
 
 
3537 aa  178  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  35.33 
 
 
553 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  26.9 
 
 
957 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.4 
 
 
3535 aa  174  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.4 
 
 
3298 aa  174  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.4 
 
 
3419 aa  174  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  30.45 
 
 
1009 aa  167  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.45 
 
 
1772 aa  164  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  32.14 
 
 
447 aa  161  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  30.06 
 
 
809 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.55 
 
 
1650 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  34.29 
 
 
418 aa  151  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.49 
 
 
2637 aa  151  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
1060 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
949 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.34 
 
 
991 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  29.29 
 
 
828 aa  124  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  29.1 
 
 
1328 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  29.1 
 
 
919 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
916 aa  105  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  28.48 
 
 
532 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  35.4 
 
 
192 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  28.96 
 
 
717 aa  96.3  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.09 
 
 
1162 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 
1162 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 
729 aa  91.7  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 
2741 aa  90.1  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.07 
 
 
2741 aa  89.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  26.3 
 
 
893 aa  88.2  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 
1215 aa  84.7  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 
854 aa  77.8  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  40.57 
 
 
121 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  31 
 
 
989 aa  75.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  28.24 
 
 
903 aa  74.7  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 
1036 aa  74.3  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.4 
 
 
968 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  24.1 
 
 
884 aa  72  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  23.84 
 
 
1475 aa  72  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 
937 aa  70.1  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  31.93 
 
 
1039 aa  69.3  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 
846 aa  69.3  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
1025 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
1365 aa  67.8  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
1409 aa  66.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  27.94 
 
 
827 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 
851 aa  66.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 
868 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  23.79 
 
 
1051 aa  64.7  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  28.88 
 
 
909 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  24.08 
 
 
1051 aa  62.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  22.95 
 
 
923 aa  62.4  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.66 
 
 
1186 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  38.02 
 
 
814 aa  61.2  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
1054 aa  60.8  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  22.61 
 
 
782 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  24.66 
 
 
1266 aa  57.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  36.52 
 
 
811 aa  57.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  25 
 
 
565 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  28.92 
 
 
937 aa  56.2  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  22.18 
 
 
1007 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  31.21 
 
 
934 aa  55.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 
928 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  23.83 
 
 
918 aa  55.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  24.42 
 
 
874 aa  55.5  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  24.21 
 
 
1025 aa  55.1  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  28.46 
 
 
1228 aa  54.3  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  20.61 
 
 
1238 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 
1711 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  34.23 
 
 
848 aa  53.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.24 
 
 
2145 aa  53.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  24.59 
 
 
1219 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
1055 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  23.8 
 
 
985 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  27.36 
 
 
959 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  27.94 
 
 
1024 aa  52.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  29.91 
 
 
790 aa  51.6  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 
1261 aa  50.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
1779 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  28.23 
 
 
1246 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>