88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3307 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 909 aa  1873    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  25.56 
 
 		 884 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 928 aa  144  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 		 916 aa  94.7  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  28.29 
 
 		 532 aa  88.2  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.6 
 
 		 828 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  23.79 
 
 		 893 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  21.04 
 
 		 854 aa  82  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  21.77 
 
 		 717 aa  78.2  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.03 
 
 		 2741 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.11 
 
 		 2741 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1025 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  23.32 
 
 		 1328 aa  72  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 		 729 aa  71.6  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 1060 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  23.08 
 
 		 919 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.42 
 
 		 991 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  27.81 
 
 		 809 aa  68.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 1215 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  28.57 
 
 		 960 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 851 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 1162 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 796 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.91 
 
 		 1162 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 905 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  27.75 
 
 		 418 aa  66.6  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 905 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 1054 aa  66.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  29.65 
 
 		 903 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 		 868 aa  65.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 868 aa  65.1  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  26.8 
 
 		 840 aa  65.1  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  23.51 
 
 		 725 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  28.79 
 
 		 845 aa  65.1  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  30.16 
 
 		 853 aa  63.9  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 851 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  25.81 
 
 		 950 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  24.48 
 
 		 891 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  25.81 
 
 		 950 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  29.19 
 
 		 957 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 923 aa  60.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  25.55 
 
 		 1475 aa  60.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  21.93 
 
 		 989 aa  60.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1409 aa  59.7  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  24.89 
 
 		 698 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  25.42 
 
 		 1476 aa  58.2  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 822 aa  57.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.26 
 
 		 854 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 968 aa  57.4  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30 
 
 		 3537 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  22.01 
 
 		 937 aa  56.2  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  24.63 
 
 		 944 aa  55.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.82 
 
 		 3419 aa  54.7  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.37 
 
 		 3299 aa  54.3  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.82 
 
 		 3535 aa  54.7  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 883 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1460 aa  54.3  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 937 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1365 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 846 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.38 
 
 		 904 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  30.73 
 
 		 992 aa  52  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.24 
 
 		 3298 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  27.82 
 
 		 918 aa  51.2  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  21.44 
 
 		 1024 aa  51.2  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 1055 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  26.04 
 
 		 1009 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  25 
 
 		 553 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1051 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  21.62 
 
 		 811 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.11 
 
 		 1007 aa  48.9  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  24.3 
 
 		 1266 aa  48.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1028 aa  47.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 1621 aa  47.8  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 885 aa  47.8  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  24.36 
 
 		 192 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  25.62 
 
 		 814 aa  47.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1636  hypothetical protein  26.83 
 
 		 442 aa  46.6  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 1711 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1142 aa  45.8  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1039 aa  45.8  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  25.13 
 
 		 650 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  21.88 
 
 		 959 aa  45.8  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.88 
 
 		 636 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  25.81 
 
 		 447 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  23.58 
 
 		 905 aa  44.7  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  26.09 
 
 		 919 aa  44.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  22.33 
 
 		 997 aa  44.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>