54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2379 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 814 aa  1523    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  52.93 
 
 		 811 aa  612  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  33.18 
 
 		 890 aa  214  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  33.61 
 
 		 890 aa  201  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  35.61 
 
 		 897 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  37.54 
 
 		 848 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  40.36 
 
 		 751 aa  124  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  30.38 
 
 		 595 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 880 aa  120  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  34.92 
 
 		 883 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  36.45 
 
 		 873 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  34.08 
 
 		 874 aa  115  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 811 aa  109  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  39.13 
 
 		 689 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 902 aa  107  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  36.28 
 
 		 905 aa  96.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0617  Tetratricopeptide TPR_4  36.99 
 
 		 861 aa  72.8  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  37.86 
 
 		 916 aa  70.9  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 846 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 		 729 aa  63.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  38.02 
 
 		 851 aa  61.6  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1051 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  29.41 
 
 		 447 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  30.9 
 
 		 827 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  33.33 
 
 		 717 aa  59.3  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  32.19 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  26.85 
 
 		 992 aa  57.8  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1164  hypothetical protein  28.02 
 
 		 643 aa  55.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  37.82 
 
 		 853 aa  55.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  33.87 
 
 		 1429 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  34.97 
 
 		 903 aa  52.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  28.32 
 
 		 418 aa  52.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  22.96 
 
 		 884 aa  51.6  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  31.46 
 
 		 1020 aa  50.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.17 
 
 		 2741 aa  50.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  37.82 
 
 		 1241 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1925  hypothetical protein  27.83 
 
 		 783 aa  50.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  29.03 
 
 		 1009 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  40.58 
 
 		 1475 aa  48.9  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.24 
 
 		 991 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.45 
 
 		 2741 aa  48.9  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.83 
 
 		 1186 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 868 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 1409 aa  48.5  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1142 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 1298 aa  48.5  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  30.08 
 
 		 840 aa  47.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  22.5 
 
 		 909 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.56 
 
 		 828 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 851 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  29.91 
 
 		 809 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1019  hypothetical protein  31.97 
 
 		 659 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.172565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 1025 aa  45.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 		 1060 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>