55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0617 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0617  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 861 aa  1613    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  34.35 
 
 		 811 aa  211  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  33.58 
 
 		 883 aa  181  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  30.86 
 
 		 595 aa  177  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  31.6 
 
 		 890 aa  169  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 880 aa  155  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  31.66 
 
 		 897 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  32.31 
 
 		 890 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  33.42 
 
 		 902 aa  144  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  31.99 
 
 		 873 aa  141  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  37.06 
 
 		 874 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  34.56 
 
 		 811 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  33.74 
 
 		 751 aa  103  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  45.09 
 
 		 848 aa  102  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  38.89 
 
 		 814 aa  99.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  31.03 
 
 		 689 aa  91.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 916 aa  87.4  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  36.36 
 
 		 905 aa  81.6  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  30.1 
 
 		 717 aa  72.8  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  35.42 
 
 		 1142 aa  61.6  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 		 1060 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.09 
 
 		 2741 aa  57.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 827 aa  57.4  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33 
 
 		 2741 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 868 aa  56.2  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.34 
 
 		 991 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  26.78 
 
 		 809 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 		 846 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 		 729 aa  52.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  25.57 
 
 		 992 aa  51.6  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.39 
 
 		 1007 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 877 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  32.17 
 
 		 959 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  34.16 
 
 		 1171 aa  49.7  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  28.04 
 
 		 893 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1051 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 1409 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1162 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.17 
 
 		 1162 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 361 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.31 
 
 		 988 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  28.45 
 
 		 918 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1147 aa  47  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 949 aa  45.8  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3592  hypothetical protein  29.17 
 
 		 419 aa  46.2  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.31 
 
 		 1056 aa  45.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1096 aa  45.8  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  27.68 
 
 		 447 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  20.62 
 
 		 532 aa  45.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1104 aa  44.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 1544 aa  44.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 392 aa  44.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  34.13 
 
 		 934 aa  44.7  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 1621 aa  44.3  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 425 aa  44.3  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>